98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0854 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  32.33 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  30.52 
 
 		 152 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  28.74 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  29.71 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  37.17 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  32.12 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  32 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  31.45 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  32.12 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  30.61 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1119  regulatory protein RecX  30.28 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  27.87 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  28.35 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  32.37 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  30.53 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  28.86 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  34.38 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  29.63 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  34.38 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  39.02 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  29.94 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  33.85 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  30.06 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  32.56 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  30.3 
 
 		 153 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  37.21 
 
 		 149 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  34.18 
 
 		 151 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  29.19 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  30.58 
 
 		 164 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  28.76 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  30.19 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  40.74 
 
 		 153 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  26.95 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  32.46 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  29.33 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  33.7 
 
 		 159 aa  52.4  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  27.07 
 
 		 159 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  32.12 
 
 		 137 aa  52  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  29.06 
 
 		 152 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  29.32 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  38.1 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  38.1 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  28.67 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  28.67 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  35.29 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  22.94 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  25.56 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  28.86 
 
 		 159 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  29.57 
 
 		 175 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  27.19 
 
 		 174 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  30.48 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  31.15 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  30.91 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  34.58 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  30.5 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  30.22 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  34.09 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  39.02 
 
 		 155 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  29.82 
 
 		 150 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  24.75 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  26.87 
 
 		 155 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  29.08 
 
 		 150 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  27.34 
 
 		 160 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  26.85 
 
 		 159 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  25.66 
 
 		 152 aa  46.2  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  34.48 
 
 		 148 aa  45.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  32.1 
 
 		 152 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  29.71 
 
 		 152 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  27.52 
 
 		 159 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  26.56 
 
 		 152 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  30.43 
 
 		 156 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  31.19 
 
 		 160 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  27.39 
 
 		 150 aa  45.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  29.37 
 
 		 156 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  35.63 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  29.37 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  33.09 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  27.78 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  27.89 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  30.25 
 
 		 129 aa  43.5  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  26.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  28.44 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  27.41 
 
 		 150 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  23.19 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  27.61 
 
 		 162 aa  42.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  30.6 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  24.55 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  30.33 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  35.8 
 
 		 338 aa  42.4  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  27.66 
 
 		 145 aa  42.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  27.61 
 
 		 155 aa  42.4  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  31.48 
 
 		 162 aa  42  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  27.86 
 
 		 235 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  35.62 
 
 		 225 aa  42  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  28.17 
 
 		 235 aa  42  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>