More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13622 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  100 
 
 		 304 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  76.6 
 
 		 290 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  72.92 
 
 		 288 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  72.92 
 
 		 288 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  72.92 
 
 		 288 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  76.39 
 
 		 291 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  63.19 
 
 		 300 aa  354  7.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  62.84 
 
 		 303 aa  347  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  61.03 
 
 		 329 aa  329  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  60.14 
 
 		 293 aa  324  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  58.87 
 
 		 296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  56.84 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  62.06 
 
 		 300 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  55.79 
 
 		 291 aa  292  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  55.48 
 
 		 291 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  53.4 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  54.64 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  56.74 
 
 		 299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  51.17 
 
 		 310 aa  279  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  55.78 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  55.67 
 
 		 299 aa  275  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  54.88 
 
 		 307 aa  275  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  54.09 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  54.06 
 
 		 288 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  51.77 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  52.65 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  50.87 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  54.68 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  53.41 
 
 		 581 aa  239  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  50 
 
 		 285 aa  235  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  48.7 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  51.94 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  46.77 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  46.86 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  46.76 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  39.07 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  51.46 
 
 		 347 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  39.75 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  43.75 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  39.93 
 
 		 323 aa  162  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  40.82 
 
 		 317 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  40.24 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  42.38 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  38.23 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  41.63 
 
 		 388 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.52 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  39.09 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 358 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1001  HhH-GPD family protein  43.96 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  41.13 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  40.95 
 
 		 358 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  39.2 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  42.04 
 
 		 349 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.65 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.69 
 
 		 355 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  37.91 
 
 		 373 aa  143  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  38.68 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  40.38 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  40.19 
 
 		 384 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  38.81 
 
 		 401 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  40.29 
 
 		 364 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  42.36 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  39.63 
 
 		 365 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  43.75 
 
 		 383 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  39.34 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  39.9 
 
 		 355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  41.2 
 
 		 382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  39.13 
 
 		 615 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  39.04 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  36.04 
 
 		 365 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  42.42 
 
 		 357 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  38.35 
 
 		 352 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  40.37 
 
 		 392 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  35.85 
 
 		 350 aa  139  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  38.94 
 
 		 373 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  36.04 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.09 
 
 		 345 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  39.67 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  38.35 
 
 		 352 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  35.53 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  35.53 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  35.53 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  35.53 
 
 		 365 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  36.04 
 
 		 365 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  39.76 
 
 		 371 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  36.04 
 
 		 365 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  35.53 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  35.53 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.41 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  40.49 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.64 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.92 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.82 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  39.27 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  39.5 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  38.89 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  40.57 
 
 		 319 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  39.8 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.86 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  30.36 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>