230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1551 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1551  cobalamin biosynthesis protein CbiB  100 
 
 		 326 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.529167  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0838  adenosylcobinamide-phosphate synthase  63.09 
 
 		 348 aa  352  7e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20061  putative cobalamin biosynthetic protein  63.3 
 
 		 302 aa  339  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13641  putative cobalamin biosynthetic protein  51.54 
 
 		 329 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00725389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0882  adenosylcobinamide-phosphate synthase  46.93 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17371  putative cobalamin biosynthetic protein  48.38 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14771  putative cobalamin biosynthetic protein  35.17 
 
 		 337 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15151  putative cobalamin biosynthetic protein  34.78 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.216618  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15021  putative cobalamin biosynthetic protein  34.67 
 
 		 337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1413  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.62 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1861  cobalamin biosynthesis protein  38.14 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1441  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.7 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3127  cobalamin biosynthesis protein  39.56 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3805  cobalamin biosynthesis protein CobD  40 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3857  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.19 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.932338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2178  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.87 
 
 		 316 aa  188  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0418  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.65 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1441  cobalamin biosynthesis protein  40.51 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.282346  normal  0.506208 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.03 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  34.56 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  36.16 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.41 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1847  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.24 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  34.65 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.67 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.74 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.38 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.87 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.01 
 
 		 320 aa  145  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  37.54 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  31.9 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  37.58 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1138  cobalamin biosynthesis protein  34.78 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  37.58 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  37.3 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  34.7 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  37.27 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  37.27 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  31.6 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.27 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.4 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.67 
 
 		 313 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.62 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.52 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.91 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.45 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.78 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  34.16 
 
 		 333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.33 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6127  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.19 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00302618  hitchhiker  0.00095084 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  36.57 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.91 
 
 		 317 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.29 
 
 		 318 aa  129  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1068  cobalamin biosynthesis protein  33.54 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.882793  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  34.13 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  32.21 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  31.54 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.09 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  39.61 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.88 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0538  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.87 
 
 		 299 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.22 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2715  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.57 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0370  cobalamin biosynthesis protein  34.47 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.62 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2576  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.1 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.36 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  32.52 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.54 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  29.91 
 
 		 336 aa  119  7e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1704  cobalamin biosynthesis protein  29.6 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.574312  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2389  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.88 
 
 		 357 aa  119  9e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1743  cobalamin biosynthesis protein  35.33 
 
 		 317 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.192923 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0555  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.1 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0238  cobalamin biosynthesis protein  30.18 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2224  cobalamin biosynthesis protein  39.61 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.55 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.12 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  32.72 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  36.25 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  33.23 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0174  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.3 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1529  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.05 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.292471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  33.23 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  36.36 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.55 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3382  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.71 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0114495  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2886  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.99 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0833  cobalamin biosynthesis protein CbiB  33.65 
 
 		 374 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0399526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0872  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.67 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  33.93 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.8 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2355  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.97 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2621  cobalamin biosynthesis protein  35.62 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246707  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0561  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.69 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.53 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1005  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.88 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2087  cobalamin biosynthesis protein CobD  40.74 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  35.42 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  32.31 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>