207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1429 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  784    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1070  hypothetical protein  56.59 
 
 		 387 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15361  NAD binding site  50.5 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.298365 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  42 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  35.27 
 
 		 422 aa  196  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4688  monooxygenase FAD-binding  30.83 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  22.16 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  26.14 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.32 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.47 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  25.94 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  29.64 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  29.02 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  28.16 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  28.02 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  23.2 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  29.06 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  26 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  26.26 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 391 aa  67  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.81 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.81 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  25.16 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.22 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  25.16 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.2 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  24.4 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  24.18 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.14 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  23.75 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  23.73 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  23.53 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.65 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  29.15 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  22.89 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  22.62 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.4 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  24.06 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  24.18 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  23.33 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  22.74 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  22.12 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  22.37 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.46 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.88 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.6 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  23.48 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  28.73 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  22.85 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  20.6 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  27.19 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.12 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  27.81 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  22.38 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.26 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  25.84 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  23.78 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.26 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.32 
 
 		 449 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  26.06 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.23 
 
 		 461 aa  56.2  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  21.1 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  23.03 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  23.45 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  21.1 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  26.32 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  23.67 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  24.06 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  28.76 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  20.48 
 
 		 445 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  22.35 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  29.31 
 
 		 493 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  23.87 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  22.86 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  29.81 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  21.91 
 
 		 455 aa  53.9  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  23.64 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  24.36 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.13 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  24.07 
 
 		 405 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>