248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1171 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1171  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.354139  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5989  extracellular solute-binding protein  33.17 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3502  extracellular solute-binding protein  32.21 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3985  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394348 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0948  extracellular solute-binding protein family 3  34.36 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.476623  normal  0.138146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1722  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.67 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.98 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  29.21 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  29.21 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  27.57 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  25.94 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1534  extracellular solute-binding protein  33.15 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.58 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  25.98 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.74 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.56 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9241  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  30 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431344  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  26.48 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.17 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  25.97 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.37 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  26.37 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.37 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  25.97 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  27.32 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1239  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 736 aa  59.7  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.33 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  35.42 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6340  extracellular solute-binding protein family 3  25.67 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.646193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3001  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 725 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.620966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  22.86 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.71 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.71 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.71 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.71 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.71 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.71 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  35.16 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.07 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  28.04 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.07 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  23.93 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  33.71 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  24.23 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  25.77 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  24.86 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.3 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0738  Prephenate dehydratase  27.64 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  26.82 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3583  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 		 738 aa  52.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  30.43 
 
 		 278 aa  52.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0925  extracellular solute-binding protein family 3  27.36 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.796106 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3757  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 722 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00680272 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  32.18 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0706  Prephenate dehydratase  27.5 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>