121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3879 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  66.81 
 
 		 491 aa  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  66.38 
 
 		 491 aa  666    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  66.38 
 
 		 491 aa  665    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  66.67 
 
 		 481 aa  669    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  66.17 
 
 		 481 aa  666    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  66.67 
 
 		 481 aa  671    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  100 
 
 		 477 aa  990    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  67.54 
 
 		 481 aa  664    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  61.68 
 
 		 481 aa  627  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  49.35 
 
 		 473 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  45.6 
 
 		 491 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  45.62 
 
 		 487 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  45.38 
 
 		 471 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  45.34 
 
 		 485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  44.28 
 
 		 487 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  39.45 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  39.22 
 
 		 486 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  51.52 
 
 		 216 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  51.87 
 
 		 197 aa  214  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  51.24 
 
 		 221 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  51.53 
 
 		 221 aa  212  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  51.53 
 
 		 221 aa  212  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  51.53 
 
 		 221 aa  212  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  51.53 
 
 		 221 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  48.33 
 
 		 221 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  51.76 
 
 		 221 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  53.97 
 
 		 221 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  51.02 
 
 		 221 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  50.77 
 
 		 221 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  45.93 
 
 		 458 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  45.24 
 
 		 455 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  44.76 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  45.71 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  45.71 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  45.5 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  44.5 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  45.41 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  45 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  45 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  44.29 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  47.67 
 
 		 456 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  44.29 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  46.8 
 
 		 456 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  47.31 
 
 		 459 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  46.56 
 
 		 201 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  46.2 
 
 		 458 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  42.08 
 
 		 201 aa  170  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  45.96 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  42.72 
 
 		 220 aa  162  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  38.66 
 
 		 197 aa  148  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  36 
 
 		 236 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  38.86 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  37.82 
 
 		 464 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  31.87 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  28.05 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  28.25 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  28.14 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  34.52 
 
 		 171 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 233 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  34.05 
 
 		 356 aa  103  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  34.47 
 
 		 214 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  34.47 
 
 		 214 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  34.47 
 
 		 214 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  34.47 
 
 		 214 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  34.47 
 
 		 233 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  33.5 
 
 		 245 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  27.64 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  33.98 
 
 		 214 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  34.02 
 
 		 244 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  31.31 
 
 		 211 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  33.17 
 
 		 266 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  35.2 
 
 		 338 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  33 
 
 		 266 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 192 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  34.48 
 
 		 251 aa  96.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  35.59 
 
 		 172 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  33.71 
 
 		 183 aa  94.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  32.79 
 
 		 262 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  37.76 
 
 		 185 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  32.49 
 
 		 651 aa  87.8  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  32.57 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  27.4 
 
 		 211 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  30.48 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 247 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  28 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2978  chitin-binding protein, putative  25.83 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00351674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  27.5 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  28.9 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  31.4 
 
 		 699 aa  65.1  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  23.45 
 
 		 534 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  23.45 
 
 		 534 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  23.45 
 
 		 534 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  28.32 
 
 		 729 aa  64.3  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  28.32 
 
 		 729 aa  64.3  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  27.75 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 		 727 aa  61.6  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  25.63 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  25.16 
 
 		 497 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  23.31 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>