244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4520 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  100 
 
 		 188 aa  374  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  50.27 
 
 		 184 aa  191  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  47.7 
 
 		 184 aa  174  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  45.3 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  48.11 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  48.11 
 
 		 183 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  50 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  45.99 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  44.26 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  50.3 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  43.72 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  48.47 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  48.47 
 
 		 180 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  44.75 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  48.47 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  46.74 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  44.51 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  46.74 
 
 		 184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  45.11 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  49.71 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  42.62 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  46.75 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  50.28 
 
 		 182 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  46.02 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  44.19 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  45.05 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  49.08 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  46.49 
 
 		 185 aa  151  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  49.08 
 
 		 187 aa  150  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  46.31 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  38.83 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  44.79 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  38.33 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  38.25 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  44.12 
 
 		 189 aa  147  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  42.55 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  42.44 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  40.24 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  42.69 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  45.24 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  44.58 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  39.78 
 
 		 187 aa  140  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  42.35 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  41.42 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  37.88 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  42.78 
 
 		 199 aa  137  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  42.86 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  43.86 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  41.85 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  42.94 
 
 		 180 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  44.97 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  40.76 
 
 		 201 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  39.27 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  43.35 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  40.98 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  41.07 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  43.68 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  40.56 
 
 		 196 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  38.32 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  48.19 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  41.95 
 
 		 195 aa  127  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  44.67 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  40.82 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  36.84 
 
 		 195 aa  124  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  36.7 
 
 		 187 aa  124  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  40.83 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  38.95 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  40.8 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  38.67 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  42.11 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  40.57 
 
 		 196 aa  121  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  37.31 
 
 		 197 aa  120  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  43.24 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  36.41 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  36.84 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  42.07 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  38.74 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6198  hypothetical protein  35.9 
 
 		 218 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  36.31 
 
 		 185 aa  118  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  36.52 
 
 		 198 aa  117  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  37.89 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  39.19 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  37.89 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  38.1 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  37.17 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  36.08 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  37.91 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  33.85 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  36.78 
 
 		 220 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3370  LemA family protein  37.14 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0508  LemA family protein  37.14 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3040  LemA family protein  37.14 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2052  LemA family protein  37.14 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0313  hypothetical protein  37.14 
 
 		 226 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0326  hypothetical protein  37.14 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2232  LemA family protein  37.14 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  33.83 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  38.73 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  36.81 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  40.74 
 
 		 434 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>