57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3939 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3939  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 483 aa  951    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1140  hypothetical protein  44.44 
 
 		 730 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1874  sporulation related  37.21 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138389  normal  0.137004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 968 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0640  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.41 
 
 		 689 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  30 
 
 		 581 aa  57  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  28.68 
 
 		 577 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 686 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  28.68 
 
 		 577 aa  53.9  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.64 
 
 		 1056 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 1421 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 306 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 878 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 279 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 		 1252 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  34.47 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 955 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1138 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 292 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  24.21 
 
 		 706 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.95 
 
 		 207 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 226 aa  48.5  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.4 
 
 		 839 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 465 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 393 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 634 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 249 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 1252 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 285 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 249 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.62 
 
 		 1034 aa  47.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 592 aa  47  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.63 
 
 		 2240 aa  47  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 632 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.01 
 
 		 784 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.06 
 
 		 810 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  36.49 
 
 		 174 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  31.19 
 
 		 636 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 927 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  27.27 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 1005 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.19 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.41 
 
 		 1979 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  33.33 
 
 		 2401 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 240 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 		 1073 aa  44.3  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 576 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 598 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 219 aa  43.5  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 326 aa  43.5  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 1038 aa  43.5  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 750 aa  43.5  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 543 aa  43.5  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>