More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2704 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  100 
 
 		 173 aa  338  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  57.3 
 
 		 180 aa  188  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  56.74 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  47.37 
 
 		 192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  48.44 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  42.16 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  46.67 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  43.72 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  41.94 
 
 		 187 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  45.45 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  41.88 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  44.86 
 
 		 196 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  37.43 
 
 		 185 aa  119  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  52.48 
 
 		 180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  39.63 
 
 		 207 aa  117  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  39.89 
 
 		 193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  40.64 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  40.64 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  42.96 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  37.84 
 
 		 186 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  43.87 
 
 		 187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  38.38 
 
 		 186 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  37.63 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  40.44 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  40.44 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  44.38 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  39.46 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  39.13 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  40.22 
 
 		 182 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  51.61 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  39.66 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  39.13 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  41.08 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  44.26 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  48.12 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  50.81 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.62 
 
 		 191 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  44.26 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.62 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  45.36 
 
 		 184 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  40.86 
 
 		 189 aa  107  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  42.86 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  37.97 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  50.41 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  38.79 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  38.12 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  38.18 
 
 		 208 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  31.84 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  40.56 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  46.75 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  44.26 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  39.67 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.8 
 
 		 199 aa  104  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  37.57 
 
 		 211 aa  104  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  38.51 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  47.62 
 
 		 189 aa  104  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  46.75 
 
 		 175 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  39.13 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  46.75 
 
 		 175 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  45.52 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  33.12 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  35.36 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  35.36 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  36.41 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  37.68 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  45.21 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  40.64 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  39.86 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  44.2 
 
 		 184 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  40.33 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  42.31 
 
 		 185 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  42.31 
 
 		 185 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  39.13 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  38.51 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  52.46 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  42.61 
 
 		 186 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  39.25 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  37.63 
 
 		 185 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  39.68 
 
 		 189 aa  100  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  35.71 
 
 		 178 aa  100  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.394589 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  44.83 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.83 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.87 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  43.62 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  40.11 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.87 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.87 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.83 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.83 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.83 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  49.18 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  42.03 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  35 
 
 		 228 aa  99.8  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  43.75 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  41.78 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  41.78 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  48.39 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  47.3 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  34.22 
 
 		 192 aa  99  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  37.14 
 
 		 188 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>