169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2228 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  306  8e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  44.79 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  33.58 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  39.34 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  44.79 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  32.06 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  38.71 
 
 		 135 aa  67  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  39.81 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  34.95 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  37 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  39.81 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  38.61 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  36.29 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  33.6 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  41.46 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  39.01 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  41.57 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  35.9 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  35.9 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  37.1 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  35.9 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  32.79 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  47.52 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  41.57 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  35.9 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  35.9 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  35.9 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  35.9 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  35.9 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  30.28 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  34.34 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  39.02 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  39.02 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  37.37 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  32.54 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  30.3 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  32.54 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  39.84 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  38.24 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  38.38 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  34.43 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  39.84 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  37.7 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  34.68 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  34.68 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  35.48 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  35.48 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  36.84 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  38 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  38.21 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  33.61 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  35.45 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  37.5 
 
 		 121 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  34.55 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  39.18 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  33.06 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  31.67 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  31.67 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  37.19 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  33.87 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  38 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  35.25 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  27.97 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  33.87 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  38.38 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  35.92 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3055  hypothetical protein  38.71 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170433 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  37.86 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  37.86 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  33.06 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  38.21 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  35.58 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  33.65 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  36.36 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  52.4  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  33.64 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  34.78 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  40.95 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  29.46 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  33.04 
 
 		 138 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  36.89 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  33.68 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  33.68 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  33.68 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  33.68 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  33.68 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  31.11 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  33.68 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  33.68 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  31.39 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  38.94 
 
 		 142 aa  50.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  34.65 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  38.89 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  37.5 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  33.59 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  34.78 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  37.93 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>