198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0411 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  53.41 
 
 		 756 aa  766    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  57.43 
 
 		 767 aa  874    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 748 aa  1513    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  32.69 
 
 		 743 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 		 842 aa  278  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  27.81 
 
 		 776 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  27.33 
 
 		 886 aa  273  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  26.96 
 
 		 780 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  27.22 
 
 		 777 aa  266  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  28.66 
 
 		 876 aa  264  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  27.73 
 
 		 786 aa  264  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  28.54 
 
 		 876 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  27.23 
 
 		 784 aa  263  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  27.54 
 
 		 886 aa  262  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  28.25 
 
 		 886 aa  262  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  28.01 
 
 		 786 aa  259  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  26.89 
 
 		 861 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  27.2 
 
 		 792 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  28.32 
 
 		 816 aa  255  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  27.23 
 
 		 792 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  27.82 
 
 		 862 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  27.56 
 
 		 859 aa  254  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  27.78 
 
 		 746 aa  253  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  27.34 
 
 		 829 aa  249  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  27.96 
 
 		 831 aa  249  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  27.47 
 
 		 833 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  26.41 
 
 		 842 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  27.94 
 
 		 837 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  27.38 
 
 		 833 aa  245  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  27.13 
 
 		 892 aa  243  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  27.65 
 
 		 781 aa  243  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  27.92 
 
 		 889 aa  235  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  24.97 
 
 		 791 aa  228  4e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  29.08 
 
 		 724 aa  226  9e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  26.62 
 
 		 804 aa  218  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  26.36 
 
 		 714 aa  197  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  26.36 
 
 		 714 aa  197  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  24.83 
 
 		 716 aa  192  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 731 aa  188  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  27.46 
 
 		 715 aa  187  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  25.32 
 
 		 712 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  24.5 
 
 		 997 aa  110  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  24.09 
 
 		 912 aa  103  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  30.74 
 
 		 788 aa  103  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  23.91 
 
 		 784 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  23.91 
 
 		 784 aa  102  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  23.91 
 
 		 784 aa  102  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  23.91 
 
 		 784 aa  102  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  23.91 
 
 		 784 aa  102  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  24.71 
 
 		 785 aa  102  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  23.91 
 
 		 784 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  24.26 
 
 		 784 aa  102  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  31.02 
 
 		 788 aa  101  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  23.97 
 
 		 786 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  25.55 
 
 		 781 aa  101  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  23.85 
 
 		 786 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  23.97 
 
 		 786 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  23.85 
 
 		 786 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  33.19 
 
 		 819 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  23.78 
 
 		 784 aa  99.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  30.33 
 
 		 789 aa  99.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  28.71 
 
 		 686 aa  98.6  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  32.08 
 
 		 822 aa  98.6  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  29.22 
 
 		 786 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  29.22 
 
 		 786 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  29.22 
 
 		 786 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  31.46 
 
 		 786 aa  94.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  29.67 
 
 		 787 aa  93.6  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  29.67 
 
 		 787 aa  93.6  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  29.67 
 
 		 787 aa  93.6  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  29.67 
 
 		 787 aa  93.6  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  29.67 
 
 		 787 aa  93.6  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  29.67 
 
 		 787 aa  93.6  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  29.67 
 
 		 761 aa  93.6  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  30.99 
 
 		 786 aa  92.8  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  23.36 
 
 		 799 aa  92  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  23.31 
 
 		 773 aa  92  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  29.63 
 
 		 786 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  22.52 
 
 		 778 aa  92  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  29.63 
 
 		 786 aa  92  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  31.02 
 
 		 787 aa  91.3  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  28.52 
 
 		 799 aa  90.5  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  23.7 
 
 		 801 aa  89.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  29.17 
 
 		 814 aa  89.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  29.61 
 
 		 762 aa  89  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  27.02 
 
 		 787 aa  87.8  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  30.84 
 
 		 863 aa  86.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  32.54 
 
 		 860 aa  86.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  24.11 
 
 		 781 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  27.92 
 
 		 813 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  27.8 
 
 		 816 aa  85.1  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  29.46 
 
 		 808 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  28.52 
 
 		 813 aa  84.7  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  26.23 
 
 		 792 aa  84.3  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  22.98 
 
 		 781 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  28.63 
 
 		 824 aa  84  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  28.93 
 
 		 727 aa  84  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  28.93 
 
 		 701 aa  83.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  26.23 
 
 		 792 aa  83.2  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  30.37 
 
 		 776 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>