More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21630 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  100 
 
 		 438 aa  828    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  78.72 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  58.2 
 
 		 440 aa  363  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  55.5 
 
 		 418 aa  346  6e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  56.2 
 
 		 421 aa  342  9e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  51.17 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  55.19 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  60.44 
 
 		 418 aa  323  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  58.44 
 
 		 419 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  59.76 
 
 		 415 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  59.76 
 
 		 415 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  59.76 
 
 		 415 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  56.4 
 
 		 459 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  58.13 
 
 		 408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  58.46 
 
 		 408 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  55.29 
 
 		 428 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  55.83 
 
 		 411 aa  276  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  52.59 
 
 		 407 aa  249  5e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  37.26 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  50.27 
 
 		 430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  38.71 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  36.32 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  48.78 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  38.06 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  37.86 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 449 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  30.33 
 
 		 436 aa  149  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4639  amino acid permease-associated region  56.13 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  36.03 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  25.8 
 
 		 471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  25.8 
 
 		 471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  26.3 
 
 		 471 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.08 
 
 		 471 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.7 
 
 		 422 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  25.06 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  32.8 
 
 		 488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 518 aa  126  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  31.18 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.25 
 
 		 460 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.72 
 
 		 489 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.97 
 
 		 486 aa  120  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.97 
 
 		 486 aa  120  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  27.73 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  27.73 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  27.73 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.06 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.59 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.06 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.06 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  27.73 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  27.73 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.06 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.06 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  27.73 
 
 		 467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  24.82 
 
 		 471 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  24.82 
 
 		 471 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 		 539 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  27.62 
 
 		 485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  28.57 
 
 		 467 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  30.97 
 
 		 764 aa  117  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 496 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 496 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  28.28 
 
 		 467 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.3 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 471 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  28.84 
 
 		 491 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 510 aa  114  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  25.22 
 
 		 525 aa  113  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0408  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 410 aa  113  8.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 494 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 476 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4398  amino acid permease-associated region  32.41 
 
 		 488 aa  113  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 466 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  22.91 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  23.89 
 
 		 463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  29.1 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 770 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  30.03 
 
 		 495 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  27.06 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  25.71 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 504 aa  110  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 		 466 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 491 aa  109  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.71 
 
 		 471 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 745 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  26.24 
 
 		 753 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>