237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17900 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17900  predicted aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 323 aa  638    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.215694  normal  0.505418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3590  aminoglycoside phosphotransferase  56.84 
 
 		 370 aa  315  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1901  aminoglycoside phosphotransferase  44.13 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.05669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1947  aminoglycoside phosphotransferase  44.13 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1881  aminoglycoside phosphotransferase  43.77 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4570  aminoglycoside phosphotransferase  34.14 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303984  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.64 
 
 		 338 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  31.51 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  33.77 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  31.99 
 
 		 339 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  31.68 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  32.32 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  30.93 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  31.44 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  31.12 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4000  aminoglycoside phosphotransferase  33.11 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  28.21 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  30.42 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  27.64 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  27.13 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  28.76 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  30.07 
 
 		 352 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  25.89 
 
 		 354 aa  102  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  31.43 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  30.48 
 
 		 368 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  30.74 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  30.28 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  30.48 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  31.6 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 		 356 aa  99.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  29.58 
 
 		 391 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  31.49 
 
 		 451 aa  99.4  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  28.48 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  31.79 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 		 353 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  29.85 
 
 		 350 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  28.82 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  26.48 
 
 		 354 aa  96.3  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 353 aa  96.3  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  26.62 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2028  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 		 350 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00704541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  29.5 
 
 		 365 aa  95.9  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  29.05 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  30.72 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  30.19 
 
 		 355 aa  95.1  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  27.52 
 
 		 354 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.35 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  30.87 
 
 		 362 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  29.84 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  30.34 
 
 		 368 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  27.95 
 
 		 336 aa  93.2  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  31.31 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  27.81 
 
 		 363 aa  92.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  27.8 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  27.48 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  27.83 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  29.97 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  28.34 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  24.53 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  30.26 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  28.1 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  27.89 
 
 		 362 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  30.13 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  33.97 
 
 		 337 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  27.71 
 
 		 345 aa  89.7  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  28.86 
 
 		 362 aa  89.7  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  26.8 
 
 		 362 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 		 348 aa  89  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  27.87 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  26.4 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  28.83 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  28.21 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  27.89 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  27.51 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  24.19 
 
 		 364 aa  87.4  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6361  aminoglycoside phosphotransferase  29.06 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00784596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  27.01 
 
 		 357 aa  86.3  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  26.33 
 
 		 354 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  25.48 
 
 		 344 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  31.27 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  30.91 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  29.04 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  29.37 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  25.64 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  30.19 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2652  aminoglycoside phosphotransferase  26.81 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000355622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  31 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  30.19 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  30.19 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  28.18 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  28.24 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  29.75 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  27.64 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  31 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  31 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>