More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1892 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  52.72 
 
 		 645 aa  684    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  50.31 
 
 		 642 aa  690    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  49.46 
 
 		 643 aa  644    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  49.92 
 
 		 643 aa  648    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  48.62 
 
 		 644 aa  638    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 		 655 aa  1338    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  49.46 
 
 		 643 aa  644    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  54.64 
 
 		 641 aa  717    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  51.89 
 
 		 642 aa  698    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  49.31 
 
 		 638 aa  633  1e-180  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  37.01 
 
 		 751 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  36.94 
 
 		 618 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.74 
 
 		 643 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  37.63 
 
 		 643 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  37.63 
 
 		 643 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  38.22 
 
 		 761 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  35.68 
 
 		 654 aa  366  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  36.11 
 
 		 646 aa  365  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  36.45 
 
 		 693 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  36.27 
 
 		 704 aa  362  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  36.74 
 
 		 707 aa  360  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  34.94 
 
 		 640 aa  359  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  35.69 
 
 		 667 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  37.09 
 
 		 806 aa  355  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  36.74 
 
 		 709 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  36.74 
 
 		 709 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  36.74 
 
 		 709 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 662 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  36.43 
 
 		 705 aa  351  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  35.25 
 
 		 640 aa  350  5e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  35.95 
 
 		 679 aa  349  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  37.91 
 
 		 727 aa  349  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  36.28 
 
 		 713 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  36.28 
 
 		 713 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  36.28 
 
 		 713 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  36.11 
 
 		 713 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  36.11 
 
 		 713 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  36.11 
 
 		 713 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  36.18 
 
 		 714 aa  345  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  35.78 
 
 		 661 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  35.95 
 
 		 625 aa  344  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  35.91 
 
 		 714 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  36.23 
 
 		 744 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.35 
 
 		 765 aa  342  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  34.84 
 
 		 710 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  35.82 
 
 		 687 aa  340  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  31.92 
 
 		 796 aa  340  7e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  36.98 
 
 		 714 aa  339  8e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  37.27 
 
 		 714 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  34.35 
 
 		 757 aa  335  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  36.33 
 
 		 656 aa  333  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  36.75 
 
 		 727 aa  333  9e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  36.62 
 
 		 728 aa  332  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  36.6 
 
 		 727 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  34.01 
 
 		 705 aa  330  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  34.98 
 
 		 648 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  35.08 
 
 		 701 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  35.86 
 
 		 776 aa  330  6e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 680 aa  330  6e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  35.19 
 
 		 748 aa  330  7e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  36.53 
 
 		 755 aa  328  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  34.59 
 
 		 676 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  33.18 
 
 		 795 aa  326  9e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  36.72 
 
 		 680 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  37.07 
 
 		 680 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  36.9 
 
 		 667 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.36 
 
 		 648 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  34.92 
 
 		 649 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  36.9 
 
 		 680 aa  321  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  32.14 
 
 		 766 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  36.72 
 
 		 680 aa  320  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  34.55 
 
 		 683 aa  320  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  36.9 
 
 		 680 aa  320  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  34.55 
 
 		 683 aa  320  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  35.01 
 
 		 829 aa  320  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  32.97 
 
 		 665 aa  319  1e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  36.72 
 
 		 673 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  34.88 
 
 		 683 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  36.72 
 
 		 673 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  35.53 
 
 		 679 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  34.38 
 
 		 683 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  33.02 
 
 		 683 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  34.38 
 
 		 683 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.5 
 
 		 712 aa  318  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  36.05 
 
 		 780 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  34.43 
 
 		 683 aa  317  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  36.85 
 
 		 741 aa  317  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  33.88 
 
 		 683 aa  316  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  34.82 
 
 		 683 aa  316  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  32.87 
 
 		 720 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  33.88 
 
 		 681 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  32.3 
 
 		 811 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2152  penicillin-binding protein 1A  32.2 
 
 		 773 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.431826  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  34.11 
 
 		 683 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  36.03 
 
 		 712 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  34.73 
 
 		 728 aa  313  9e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  35.63 
 
 		 626 aa  312  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  33.94 
 
 		 683 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  35.28 
 
 		 679 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0679  penicillin-binding protein 1B  34.15 
 
 		 772 aa  312  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.963541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>