164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0239 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1181    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  67.65 
 
 		 577 aa  823    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  42.3 
 
 		 591 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  35.96 
 
 		 575 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  29.54 
 
 		 595 aa  257  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  28.57 
 
 		 607 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 546 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  32.38 
 
 		 587 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  31.07 
 
 		 593 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  29.86 
 
 		 594 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  29.5 
 
 		 544 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  31.67 
 
 		 569 aa  209  9e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  29.18 
 
 		 569 aa  209  9e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  29.02 
 
 		 579 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  30.27 
 
 		 550 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  29.38 
 
 		 623 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  28.9 
 
 		 591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  28.65 
 
 		 709 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  26.49 
 
 		 679 aa  173  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  25.98 
 
 		 584 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  29.46 
 
 		 570 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  27.59 
 
 		 599 aa  166  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  27.72 
 
 		 590 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  25.13 
 
 		 583 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  24.96 
 
 		 617 aa  161  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  26.15 
 
 		 612 aa  161  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  27.93 
 
 		 693 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  26.29 
 
 		 674 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  24.73 
 
 		 560 aa  160  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  25.64 
 
 		 583 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  26.39 
 
 		 628 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  26.96 
 
 		 582 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  26.85 
 
 		 679 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  27.03 
 
 		 583 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  26.81 
 
 		 662 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  31.11 
 
 		 674 aa  141  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  25.16 
 
 		 574 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  32.84 
 
 		 714 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  30.45 
 
 		 664 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  27.49 
 
 		 626 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  25.79 
 
 		 526 aa  137  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  32.73 
 
 		 709 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  25.75 
 
 		 559 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  33.76 
 
 		 670 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  41.62 
 
 		 659 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  25.57 
 
 		 563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  24.18 
 
 		 567 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  26.64 
 
 		 603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  22.52 
 
 		 570 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  25.83 
 
 		 605 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  24.61 
 
 		 493 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  26.29 
 
 		 496 aa  110  9.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  36.05 
 
 		 617 aa  108  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  25.05 
 
 		 601 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  24.68 
 
 		 600 aa  108  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  23.81 
 
 		 611 aa  105  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  25.98 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  23.84 
 
 		 497 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  24.49 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  23.84 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  26.01 
 
 		 531 aa  100  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  26.83 
 
 		 557 aa  96.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  24.17 
 
 		 581 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  32.34 
 
 		 608 aa  93.6  9e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  26.26 
 
 		 524 aa  92.8  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  23.76 
 
 		 628 aa  92  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  32.14 
 
 		 557 aa  89.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  29.05 
 
 		 520 aa  89.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  26.18 
 
 		 492 aa  89.4  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  33.54 
 
 		 427 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  33.97 
 
 		 616 aa  87  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  36 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  22.17 
 
 		 559 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  24.5 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  31.07 
 
 		 590 aa  80.1  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  28.49 
 
 		 589 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  35.59 
 
 		 561 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  29.7 
 
 		 589 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  24.22 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  31.21 
 
 		 560 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  34.07 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  31.25 
 
 		 592 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  31.88 
 
 		 580 aa  72  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  27.85 
 
 		 659 aa  70.5  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  31.72 
 
 		 537 aa  70.1  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  24.21 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  26.2 
 
 		 564 aa  67.4  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  29.22 
 
 		 506 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  31.01 
 
 		 250 aa  67  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2109  protein of unknown function DUF87  40.85 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000368581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  23.46 
 
 		 579 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  23.23 
 
 		 572 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3692  protein of unknown function DUF87  46.77 
 
 		 382 aa  60.1  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  30.83 
 
 		 655 aa  60.1  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  33.05 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  28.47 
 
 		 744 aa  59.3  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  21.16 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  37.74 
 
 		 643 aa  59.7  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  28.32 
 
 		 595 aa  57.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  24.57 
 
 		 538 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>