295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3347 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  100 
 
 		 201 aa  390  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  86.57 
 
 		 201 aa  348  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  65.13 
 
 		 423 aa  250  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  63.45 
 
 		 199 aa  244  9e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  64.14 
 
 		 201 aa  241  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  68 
 
 		 200 aa  239  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  61.08 
 
 		 207 aa  225  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  58.79 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  58.79 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  58.79 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  57 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3123  MCP methyltransferase, CheR-type  60.41 
 
 		 198 aa  211  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  55.78 
 
 		 201 aa  208  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  57.07 
 
 		 201 aa  207  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  57.61 
 
 		 200 aa  204  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5057  Methyltransferase type 12  57.79 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  52.36 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  50.26 
 
 		 192 aa  167  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  51.34 
 
 		 205 aa  161  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  42.53 
 
 		 259 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  45.18 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  34.16 
 
 		 304 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 		 996 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  39.26 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  27.5 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  37.3 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  40.52 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  34.06 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35.97 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  32.71 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  32.71 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  32.71 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  31.78 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  31.78 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.78 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  25.48 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2162  hypothetical protein  31.35 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0386731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  35.24 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  29.41 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  29.41 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  33.04 
 
 		 258 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  29.25 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  38.66 
 
 		 278 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 337 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  38.06 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  28.43 
 
 		 249 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 257 aa  52  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 265 aa  52  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  33.66 
 
 		 253 aa  51.6  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  40.91 
 
 		 232 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  42.61 
 
 		 251 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 254 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 249 aa  51.6  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  42.2 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  30.63 
 
 		 541 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  31.91 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  28.06 
 
 		 263 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  30.63 
 
 		 541 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  30.63 
 
 		 541 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  38.14 
 
 		 274 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  30.63 
 
 		 541 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 311 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29.66 
 
 		 541 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 262 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.51 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.95 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  29.41 
 
 		 253 aa  48.5  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.11 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  36.96 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 259 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.71 
 
 		 259 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3478  hypothetical protein  24.11 
 
 		 257 aa  48.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0815915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  32.63 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  49.12 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 266 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  46.27 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  40.91 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  46.27 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.43 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 251 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1315  Methyltransferase type 12  40.52 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  22.53 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>