53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3124 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 868 aa  1735    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3349  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  60.91 
 
 		 732 aa  280  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.185499  hitchhiker  0.0040915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3119  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  59.34 
 
 		 732 aa  269  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449622  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  41.39 
 
 		 491 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  41.95 
 
 		 514 aa  191  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1257  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.92 
 
 		 528 aa  179  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1260  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.13 
 
 		 477 aa  179  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1258  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50 
 
 		 359 aa  172  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  38.74 
 
 		 1094 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  38.08 
 
 		 883 aa  164  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1261  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.03 
 
 		 496 aa  153  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  36.91 
 
 		 1201 aa  152  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3882  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.27 
 
 		 511 aa  150  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  40.49 
 
 		 534 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4549  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.23 
 
 		 690 aa  148  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  38.34 
 
 		 649 aa  140  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  29.03 
 
 		 760 aa  82  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  30.03 
 
 		 828 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3126  hypothetical protein  49.44 
 
 		 116 aa  75.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.753171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  21.89 
 
 		 690 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4328  hypothetical protein  27.18 
 
 		 288 aa  62  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  20.94 
 
 		 912 aa  58.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0723  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.73 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  20.41 
 
 		 1154 aa  58.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1328 aa  56.2  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 		 620 aa  55.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3122  Integrins alpha chain  27.03 
 
 		 254 aa  54.3  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0941302  hitchhiker  0.000197077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.05 
 
 		 552 aa  54.3  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  29.55 
 
 		 780 aa  53.9  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1008  CHAP domain-containing protein  24.88 
 
 		 562 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00120354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.4 
 
 		 474 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2703  serine protease  23.79 
 
 		 298 aa  50.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2873  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.9 
 
 		 300 aa  50.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0332194  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5959  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.39 
 
 		 271 aa  48.9  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252451  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.18 
 
 		 1340 aa  48.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  26.89 
 
 		 456 aa  48.5  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  26.55 
 
 		 506 aa  48.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1101  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.33 
 
 		 519 aa  48.1  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4440  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.79 
 
 		 290 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  27.84 
 
 		 1517 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.92 
 
 		 259 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.12 
 
 		 290 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1704  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.86 
 
 		 282 aa  47  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204445  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1430  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.86 
 
 		 297 aa  47  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.973827  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1426  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.27 
 
 		 282 aa  45.8  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  19.92 
 
 		 940 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.68 
 
 		 1113 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.38 
 
 		 1490 aa  46.2  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1210 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0694  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.25 
 
 		 284 aa  45.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6885  hypothetical protein  24.49 
 
 		 347 aa  45.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  30.72 
 
 		 1126 aa  44.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  25.86 
 
 		 409 aa  44.3  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>