More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2416 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  100 
 
 		 426 aa  831    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  84.91 
 
 		 426 aa  638    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  57.07 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  54.26 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  47.25 
 
 		 420 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  45.94 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  47.25 
 
 		 420 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  50.74 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  43.75 
 
 		 1270 aa  321  9.999999999999999e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  45.36 
 
 		 422 aa  320  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  46.73 
 
 		 575 aa  318  7.999999999999999e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  43.91 
 
 		 431 aa  312  6.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  41.15 
 
 		 439 aa  309  5e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  47.16 
 
 		 437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  45.64 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  41.42 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  45.64 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  45.38 
 
 		 422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  40.99 
 
 		 421 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  45.75 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  40.92 
 
 		 471 aa  299  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  40.66 
 
 		 470 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  44.2 
 
 		 450 aa  296  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  44.77 
 
 		 653 aa  295  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  43.75 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  45.39 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  40 
 
 		 446 aa  293  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  39.51 
 
 		 425 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  47.1 
 
 		 405 aa  286  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  40.84 
 
 		 438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  45.79 
 
 		 427 aa  283  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  40.66 
 
 		 445 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  44.44 
 
 		 416 aa  282  9e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  39.51 
 
 		 446 aa  280  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  42.28 
 
 		 430 aa  279  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  42.17 
 
 		 438 aa  279  8e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  41.73 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  42.44 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  40.59 
 
 		 441 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  42.43 
 
 		 444 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  38.05 
 
 		 447 aa  272  8.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  40.79 
 
 		 453 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  41.65 
 
 		 437 aa  269  7e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  40.67 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  37.63 
 
 		 410 aa  262  8e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  40.45 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  38.56 
 
 		 388 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.57 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  35.15 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  39.19 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  39.66 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  35.56 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  39.03 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  35.38 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  37.91 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  35.14 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  38.07 
 
 		 412 aa  190  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  34.74 
 
 		 407 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  34.33 
 
 		 392 aa  189  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  37.86 
 
 		 400 aa  189  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  36.39 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  32.03 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  34.15 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  34.79 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  35.21 
 
 		 466 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  38.48 
 
 		 393 aa  186  8e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  38.62 
 
 		 387 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  38.71 
 
 		 392 aa  186  9e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  36.03 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  36.28 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  36.82 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  38.4 
 
 		 387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  34.43 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  32.03 
 
 		 390 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  39.08 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5419  peptidase, M20D subfamily  38.34 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  38.07 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  38.07 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  38.32 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  36.16 
 
 		 387 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  36.16 
 
 		 387 aa  183  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  34.64 
 
 		 435 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  35.8 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  34.01 
 
 		 398 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  35.48 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1211  amidohydrolase  35.25 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.108173  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  34.01 
 
 		 398 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  33.66 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  38.11 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  38.58 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  37.68 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  36.46 
 
 		 396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  33.92 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  34.47 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  36.45 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  36.45 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  33.67 
 
 		 396 aa  180  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  38.53 
 
 		 395 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  35.91 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  32.33 
 
 		 480 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>