More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1793 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1793  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 595 aa  1196    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 569 aa  537  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 569 aa  533  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0350  prolyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 569 aa  531  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.918323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 567 aa  508  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3563  prolyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 566 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 572 aa  503  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 573 aa  499  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 567 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 571 aa  493  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 570 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 576 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 569 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 573 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 568 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 573 aa  488  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 575 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 570 aa  478  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 566 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 566 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 585 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 566 aa  478  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 570 aa  477  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 566 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 566 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 566 aa  475  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 566 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 566 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 566 aa  475  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 566 aa  475  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 574 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 579 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 576 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 571 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 567 aa  465  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 570 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 570 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 567 aa  465  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 566 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 578 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 575 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 574 aa  465  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 580 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 578 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 574 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 575 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 578 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 578 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 574 aa  457  1e-127  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 568 aa  456  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 578 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 578 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 578 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1267  prolyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 581 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 572 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4872  prolyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 570 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 578 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2220  prolyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 595 aa  449  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 567 aa  449  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 574 aa  451  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 578 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 578 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 587 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 580 aa  452  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 576 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4057  prolyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 574 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.391162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 584 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 578 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 578 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 573 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 578 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  43.39 
 
 		 570 aa  445  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3947  prolyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 575 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 578 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 578 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 573 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 578 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 574 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 578 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 571 aa  448  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4090  prolyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 574 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0846  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 581 aa  443  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.889779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0714  prolyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 565 aa  444  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000812251 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 572 aa  442  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 565 aa  444  1e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0775  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 581 aa  443  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1274  prolyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 580 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 577 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 580 aa  442  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 564 aa  438  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 574 aa  438  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 577 aa  438  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 574 aa  439  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 569 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0833  prolyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 580 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.508251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 569 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>