More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0921 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0864  amidase  90.34 
 
 		 466 aa  734    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241071  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0921  amidase  100 
 
 		 469 aa  910    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2037  Amidase  52.78 
 
 		 470 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0781  putative amidase  46.27 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1505  Amidase  45.96 
 
 		 461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0557  Amidase  45.23 
 
 		 436 aa  269  7e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1500  Amidase  43.53 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.902892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  40.69 
 
 		 466 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  39.02 
 
 		 484 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11289  amidase  40.09 
 
 		 462 aa  193  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  35.65 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  36.8 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3429  Amidase  41.65 
 
 		 457 aa  186  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3824  amidase  37.55 
 
 		 505 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315125  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1278  Amidase  38.44 
 
 		 485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00371719  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  38.11 
 
 		 471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3451  amidase  37.75 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3514  amidase  37.75 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3462  amidase  37.75 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.174169  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0175  amidase  38.67 
 
 		 499 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  35.05 
 
 		 477 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  39.67 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  36.4 
 
 		 476 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2712  amidase  37.72 
 
 		 504 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.917401  normal  0.488259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3358  Amidase  39.27 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000174583  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  37.3 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  33.91 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  35.13 
 
 		 499 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.91 
 
 		 473 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  38.97 
 
 		 489 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  38.5 
 
 		 489 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  33.54 
 
 		 501 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0135  amidase  38.44 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  33.69 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  38.73 
 
 		 489 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  38.73 
 
 		 489 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8973  Amidase  35.43 
 
 		 502 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37 
 
 		 493 aa  170  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  36.64 
 
 		 499 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12389  amidase  36.94 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.232492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  30.97 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  36.25 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  34.38 
 
 		 531 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  35.28 
 
 		 495 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0280  Amidase  37.55 
 
 		 469 aa  167  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  32.01 
 
 		 503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  33.33 
 
 		 472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  33.12 
 
 		 475 aa  163  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.73 
 
 		 495 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0789  Amidase  37.65 
 
 		 467 aa  160  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210255  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.59 
 
 		 475 aa  159  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  32.38 
 
 		 481 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  36.44 
 
 		 476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  29.87 
 
 		 479 aa  156  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  34.18 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  36.5 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  34.25 
 
 		 508 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0232  Amidase  38.06 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.226202  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  34.64 
 
 		 470 aa  154  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  33.9 
 
 		 503 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  35.06 
 
 		 493 aa  152  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  34.97 
 
 		 474 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.31 
 
 		 485 aa  150  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  31.83 
 
 		 498 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  32.1 
 
 		 468 aa  150  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  36.54 
 
 		 486 aa  149  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.29 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  26.76 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.54 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  31.33 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  33.68 
 
 		 474 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  30.08 
 
 		 483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  34.84 
 
 		 445 aa  147  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  31.03 
 
 		 488 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3895  amidase  36.5 
 
 		 488 aa  147  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537605  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4130  amidase  31.14 
 
 		 468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0304259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  33.96 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3208  amidase  35.65 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  30.02 
 
 		 474 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  33.97 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12902  amidase  35.07 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.828525  normal  0.749825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  30.98 
 
 		 468 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  34.1 
 
 		 501 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  29.75 
 
 		 472 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  37.25 
 
 		 492 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.81 
 
 		 486 aa  143  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  30.41 
 
 		 492 aa  143  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15821  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.58 
 
 		 486 aa  143  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.36 
 
 		 486 aa  142  9e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.56 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  33.88 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3117  Amidase  34.75 
 
 		 495 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  30.02 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.66 
 
 		 487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  28.84 
 
 		 491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  28.63 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  34.17 
 
 		 447 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  30.6 
 
 		 464 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  33.8 
 
 		 482 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.16 
 
 		 486 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>