199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0522 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0522  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1794  cyclic nucleotide-binding domain protein  32.47 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3255  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00717521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3228  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000617944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3510  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3454  cyclic nucleotide-binding domain protein  32.47 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3481  cyclic nucleotide-binding domain protein  32.47 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0295032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3165  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3162  cyclic nucleotide-binding protein  31.96 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3470  cyclic nucleotide-binding domain protein  31.96 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3461  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.44 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  29.61 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0206  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000707778  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2964  catabolite gene activator  26.96 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117686  normal  0.0504815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2212  cyclic nucleotide-binding protein  27.59 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1300  cyclic nucleotide-binding protein  26.94 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  27.18 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1761  cyclic nucleotide-binding protein  27.81 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.05 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  22.96 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.61 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  23.71 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.35 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5419  DNA-binding transcriptional activator YeiL  23.4 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5089  DNA-binding transcriptional activator YeiL  26.04 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5589  DNA-binding transcriptional activator YeiL  26.04 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5533  DNA-binding transcriptional activator YeiL  23.4 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5504  DNA-binding transcriptional activator YeiL  25.52 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5261  DNA-binding transcriptional activator YeiL  25.52 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00514717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5106  DNA-binding transcriptional activator YeiL  25.52 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.888495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.81 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5659  DNA-binding transcriptional activator YeiL  25.52 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.71 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.83 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.73 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02092  DNA-binding transcriptional activator of stationary phase nitrogen survival  26.23 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1485  DNA-binding transcriptional activator YeiL  26.23 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0399687  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02051  hypothetical protein  26.23 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2460  DNA-binding transcriptional activator YeiL  25.68 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.572747  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1495  cyclic nucleotide-binding protein  25.68 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  20.5 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  25.68 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288775  normal  0.0803895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.37 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  26.23 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2310  DNA-binding transcriptional activator YeiL  25.68 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  decreased coverage  0.000186485 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.24 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5538  DNA-binding transcriptional activator YeiL  25 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5203  DNA-binding transcriptional activator YeiL  22.87 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.16 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.5 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.44 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  22.43 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  22.05 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.65 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.96 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.47 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.03 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.13 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.94 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  22.16 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.27 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.12 
 
 		 408 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  22.56 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.39 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.37 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.6 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 209 aa  52.4  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.89 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990851  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  20.94 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.16 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.4 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4308  cyclic nucleotide-binding protein  27.1 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  22.27 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.14 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.23 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.68 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19910  Fnr-like negative transcriptional regulator of CydAB  25.64 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.76 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.47 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1913  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.205993  normal  0.953786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.17 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.81 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>