72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0808 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0808  arabinose ABC transporter, arabinose binding protein  100 
 
 		 620 aa  1253    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0654  extracellular solute-binding protein family 1  44.95 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1029  sugar-binding periplasmic protein  34.04 
 
 		 491 aa  228  3e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0247417 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 477 aa  187  4e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1257  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 		 467 aa  178  3e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 473 aa  173  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 415 aa  95.5  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 454 aa  94.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 412 aa  91.3  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 432 aa  89.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 434 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 412 aa  86.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  25.35 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  24.11 
 
 		 428 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 455 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 429 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 415 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 415 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 415 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 415 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 415 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0862  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 397 aa  54.7  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2520  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 452 aa  54.7  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.57 
 
 		 415 aa  54.3  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  23.51 
 
 		 428 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 417 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  24.91 
 
 		 420 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  22.69 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 415 aa  51.6  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1553  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  26.57 
 
 		 415 aa  51.6  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0365178  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  21.19 
 
 		 425 aa  51.2  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2129  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  26.57 
 
 		 415 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 415 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3052  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 415 aa  50.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 415 aa  50.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2615  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 415 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.813067  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0782  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 415 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3086  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  26.57 
 
 		 415 aa  50.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1028  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 415 aa  50.8  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00732462  normal  0.0899654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 420 aa  50.4  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 414 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 430 aa  50.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 420 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  25.6 
 
 		 415 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  24.42 
 
 		 420 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.65 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 428 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 420 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 431 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 419 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 428 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 428 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 416 aa  47.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 414 aa  47  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001061  ABC-type sugar transport system component  22.39 
 
 		 414 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 433 aa  45.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  22.04 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1824  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 449 aa  44.3  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 422 aa  44.3  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  28.79 
 
 		 431 aa  44.3  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>