113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1029 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1029  sugar-binding periplasmic protein  100 
 
 		 491 aa  996    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0247417 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0654  extracellular solute-binding protein family 1  50.33 
 
 		 554 aa  457  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0808  arabinose ABC transporter, arabinose binding protein  36.49 
 
 		 620 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1257  extracellular solute-binding protein  35.9 
 
 		 467 aa  260  4e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 		 477 aa  250  4e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 412 aa  110  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 412 aa  106  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 414 aa  90.1  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  24.44 
 
 		 423 aa  88.6  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  23.17 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  24.9 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0523  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3689  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  26.32 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  26.1 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4321  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1097  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000486653  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.32 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001061  ABC-type sugar transport system component  24.9 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  28.27 
 
 		 429 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.98 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  23.26 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  22.98 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  24.89 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 420 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.81 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1515  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6314  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 428 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2399  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.66 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9200  ABC-type sugar transport system periplasmic component  23.26 
 
 		 374 aa  57  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2129  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  27.08 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3086  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  27.08 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.61 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0782  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2615  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.813067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3052  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1553  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  26.98 
 
 		 415 aa  53.5  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0365178  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2416  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 417 aa  53.5  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.230559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2520  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1028  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00732462  normal  0.0899654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 411 aa  50.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2191  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.23 
 
 		 415 aa  50.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537651  hitchhiker  0.00669154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  22.12 
 
 		 411 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  26.06 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6328  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 415 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  21.68 
 
 		 411 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.072788 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0862  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 397 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1824  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0860  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 415 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0321479  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1728  extracellular solute-binding protein  21.33 
 
 		 411 aa  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00458236  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 424 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.09 
 
 		 468 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>