More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8009 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8009  Cystathionine gamma-lyase  100 
 
 		 406 aa  806    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0632  cystathionine gamma-synthase  58.1 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0191  Cystathionine gamma-lyase  52.3 
 
 		 409 aa  360  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  43.75 
 
 		 408 aa  295  9e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  39.59 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  38.64 
 
 		 392 aa  279  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  38.73 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  39.04 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  35.7 
 
 		 393 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  40.69 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  39.09 
 
 		 377 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  36.74 
 
 		 401 aa  256  5e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  34.67 
 
 		 390 aa  253  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  38.99 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  40 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  37.22 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  38.21 
 
 		 400 aa  249  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.89 
 
 		 397 aa  249  9e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  38.73 
 
 		 397 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  38.73 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  35.24 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  38.24 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  39.3 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.76 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  38.73 
 
 		 397 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  38.73 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.05 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  37.93 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  39.44 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  38.73 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  40.69 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  38.17 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  37.97 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  34.22 
 
 		 390 aa  240  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  36.39 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  36.39 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  36.13 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.74 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1420  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  35.73 
 
 		 425 aa  239  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.164572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2691  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  35.73 
 
 		 427 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118315  normal  0.592625 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0500  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.1 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.960396  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  37.4 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  37 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0960  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.37 
 
 		 427 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353784 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1309  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.1 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0637456  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.84 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  37.88 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  36.13 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  36.13 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  36.13 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1851  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.82 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2760  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  33.41 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  34.41 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  39.57 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  36.13 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  36.13 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  36.13 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  36.91 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6243  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.53 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106831  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  37.96 
 
 		 378 aa  237  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43850  Cystathionine gamma-synthase  40.3 
 
 		 396 aa  237  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  36.13 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  38.12 
 
 		 395 aa  235  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  35.75 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3288  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.12 
 
 		 427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0695666  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  37.84 
 
 		 391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  40.16 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  37.19 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.11 
 
 		 395 aa  234  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  38.35 
 
 		 392 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1656  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  36.01 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.52 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  36.61 
 
 		 397 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  37.35 
 
 		 396 aa  233  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  34.53 
 
 		 378 aa  232  8.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  39.36 
 
 		 399 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1854  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.52 
 
 		 397 aa  232  8.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  decreased coverage  0.00243487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1906  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.19 
 
 		 423 aa  232  8.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  40.41 
 
 		 394 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  37.85 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.26 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3732  Cystathionine gamma-lyase  36 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4596  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  35.33 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.997889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0734  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  32.02 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.12755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  38.67 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.86 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  33.17 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1962  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.71 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  38.46 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.77 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19090  cystathionine gamma-synthase  41.07 
 
 		 401 aa  230  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.24 
 
 		 403 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0765  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  31.85 
 
 		 421 aa  229  5e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0189805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  35.81 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2012  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  34.03 
 
 		 425 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  34.8 
 
 		 413 aa  229  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2427  O-acetylhomoserine (thiol)-lyase  31.96 
 
 		 457 aa  229  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.363581  normal  0.253558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.14 
 
 		 403 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4276  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.89 
 
 		 423 aa  229  6e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  37.83 
 
 		 407 aa  229  7e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>