More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0632 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0632  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
406 aa  796    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0191  Cystathionine gamma-lyase  68.69 
 
 
409 aa  487  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8009  Cystathionine gamma-lyase  58.1 
 
 
406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  46.75 
 
 
408 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  44.16 
 
 
390 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  39.49 
 
 
392 aa  286  5.999999999999999e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  38.86 
 
 
394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1309  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.57 
 
 
428 aa  283  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0637456  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  36.55 
 
 
393 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  41.76 
 
 
394 aa  277  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2758  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.38 
 
 
451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0682132  normal  0.179185 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1962  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.13 
 
 
422 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0790  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.9 
 
 
433 aa  270  4e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1183  O-acetyl-L-homoserine sulfhydrylase  39.76 
 
 
428 aa  265  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43850  Cystathionine gamma-synthase  45.41 
 
 
396 aa  265  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237057  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  39.2 
 
 
393 aa  265  1e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1040  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.14 
 
 
448 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0244331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1656  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.14 
 
 
437 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2760  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.24 
 
 
425 aa  263  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1719  cystathionine gamma-synthase  39.62 
 
 
429 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.72 
 
 
397 aa  262  6.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  38.99 
 
 
392 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  36.2 
 
 
390 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  39.84 
 
 
396 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  38.64 
 
 
401 aa  261  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1156  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  37.5 
 
 
434 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2390  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.57 
 
 
428 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000399699  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  38.2 
 
 
391 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.4 
 
 
389 aa  259  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  38.2 
 
 
391 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  38.73 
 
 
392 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  38.46 
 
 
391 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.29 
 
 
393 aa  259  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3288  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.95 
 
 
427 aa  259  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0695666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  37.53 
 
 
399 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1661  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.62 
 
 
460 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0278508 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  42.37 
 
 
426 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  38.2 
 
 
392 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  38.73 
 
 
392 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3160  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  39.19 
 
 
433 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1836  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.28 
 
 
433 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0643258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0960  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.49 
 
 
427 aa  257  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1015  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.58 
 
 
427 aa  257  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000358274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.1 
 
 
427 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  37.93 
 
 
392 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  39.84 
 
 
390 aa  256  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  37.93 
 
 
392 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1842  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.44 
 
 
430 aa  256  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000076838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  37.67 
 
 
391 aa  255  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3780  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.09 
 
 
436 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  33.17 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1991  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.38 
 
 
460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3245  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.35 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1678  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  39.57 
 
 
438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0986045  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2048  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  39.57 
 
 
437 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.274575  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2425  O-acetyl-L-homoserine sulfhydrylase  35.94 
 
 
427 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407766  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  41.84 
 
 
426 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4960  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  39.19 
 
 
432 aa  252  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2427  O-acetylhomoserine (thiol)-lyase  36.1 
 
 
457 aa  252  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.363581  normal  0.253558 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0010  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.85 
 
 
428 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  43.05 
 
 
391 aa  252  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1146  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.83 
 
 
429 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000163408  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  39.7 
 
 
387 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2933  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  38 
 
 
424 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.269063  hitchhiker  0.00137406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1562  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.86 
 
 
444 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0045  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.41 
 
 
430 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3249  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.9 
 
 
428 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000823089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  40.36 
 
 
397 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2770  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  42.04 
 
 
456 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0734  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.94 
 
 
429 aa  250  3e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.12755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  39.84 
 
 
392 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0045  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.18 
 
 
430 aa  250  4e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  42.67 
 
 
396 aa  250  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  42.22 
 
 
401 aa  249  5e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  40.27 
 
 
399 aa  249  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  37.97 
 
 
397 aa  249  8e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0819  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.48 
 
 
427 aa  249  8e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000136196  hitchhiker  0.00000166072 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  38.24 
 
 
397 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1380  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.59 
 
 
440 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19330  O-acetylhomoserine sulfhydrolase  41.01 
 
 
460 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.035518  normal  0.956325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5757  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  38.43 
 
 
426 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440084  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2814  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.55 
 
 
430 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1453  O-acetylhomoserine sulfhydrylase  37.2 
 
 
430 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1572  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  41.33 
 
 
444 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487287  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  38.24 
 
 
397 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  37.81 
 
 
397 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  41.05 
 
 
426 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3732  Cystathionine gamma-lyase  35.83 
 
 
393 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  41.22 
 
 
394 aa  246  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4016  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.83 
 
 
450 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227998  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2013  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.02 
 
 
428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  normal  0.048822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3718  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  38.95 
 
 
431 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2860  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.53 
 
 
433 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.429132  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  36.91 
 
 
392 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2339  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.98 
 
 
443 aa  246  8e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2537  cystathionine gamma-synthase  41.08 
 
 
410 aa  246  8e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1994  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.44 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  42.33 
 
 
392 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1757  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  38.39 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4793  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  37.96 
 
 
426 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>