More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0191 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0191  Cystathionine gamma-lyase  100 
 
 
409 aa  804    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0632  cystathionine gamma-synthase  68.51 
 
 
406 aa  484  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8009  Cystathionine gamma-lyase  52.27 
 
 
406 aa  356  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  45.2 
 
 
408 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  42.82 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  41.67 
 
 
394 aa  305  9.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  43.44 
 
 
390 aa  302  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  38.07 
 
 
393 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1656  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.05 
 
 
437 aa  290  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1661  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.93 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0278508 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1991  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.93 
 
 
460 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.05 
 
 
404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.05 
 
 
404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.62 
 
 
427 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  38.24 
 
 
390 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  42.39 
 
 
401 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3732  Cystathionine gamma-lyase  39.01 
 
 
393 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  38.97 
 
 
394 aa  280  4e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  37.37 
 
 
399 aa  279  7e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2758  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  38.98 
 
 
451 aa  279  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0682132  normal  0.179185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1562  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.38 
 
 
444 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.61 
 
 
397 aa  277  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1309  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.19 
 
 
428 aa  276  6e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0637456  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1253  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  39.22 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1134  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  39.61 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.169784  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  43.75 
 
 
399 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.32 
 
 
403 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2048  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  38.35 
 
 
437 aa  272  7e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.274575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2770  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  41.55 
 
 
456 aa  272  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3160  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  38.5 
 
 
433 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  42.71 
 
 
396 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2814  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.72 
 
 
430 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4960  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  38.35 
 
 
432 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1842  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.23 
 
 
430 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000076838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3780  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  38.94 
 
 
436 aa  269  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.41 
 
 
383 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1962  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.87 
 
 
422 aa  268  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.69 
 
 
403 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  39.78 
 
 
393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1572  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.58 
 
 
444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487287  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.1 
 
 
402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1331  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  39.37 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1836  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  38.26 
 
 
433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0643258 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  38.56 
 
 
401 aa  266  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0010  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.98 
 
 
428 aa  266  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.76 
 
 
402 aa  266  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3288  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.05 
 
 
427 aa  265  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0695666  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  41.67 
 
 
390 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  35.05 
 
 
388 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  41.94 
 
 
397 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0960  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.82 
 
 
427 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.38 
 
 
403 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0734  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.57 
 
 
429 aa  263  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.12755  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1212  Cystathionine gamma-synthase  39.79 
 
 
403 aa  264  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  39.58 
 
 
396 aa  263  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2997  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  39.56 
 
 
445 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3718  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  37.92 
 
 
431 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194867 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  38.11 
 
 
392 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  38.35 
 
 
407 aa  263  4e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  38.11 
 
 
392 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.86 
 
 
395 aa  263  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  38.58 
 
 
400 aa  262  6.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.5 
 
 
397 aa  262  8.999999999999999e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3960  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  37.92 
 
 
433 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.993193 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.73 
 
 
392 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  38.11 
 
 
392 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.37 
 
 
395 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.86 
 
 
403 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1357  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  41.23 
 
 
450 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42757  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66440  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  37.92 
 
 
425 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  38.11 
 
 
392 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2013  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.45 
 
 
428 aa  261  2e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  normal  0.048822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1719  cystathionine gamma-synthase  37.29 
 
 
429 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  37.57 
 
 
391 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.55 
 
 
402 aa  259  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.97 
 
 
403 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.6 
 
 
402 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1458  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.67 
 
 
443 aa  260  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197601  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0995  O-acetylhomoserine sulfhydrylase  36.96 
 
 
437 aa  259  4e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000385718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  37.84 
 
 
391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.34 
 
 
389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  37.84 
 
 
391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1678  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  36.64 
 
 
438 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0986045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43850  Cystathionine gamma-synthase  42.82 
 
 
396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1156  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  37.53 
 
 
434 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.43 
 
 
394 aa  259  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1124  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.07 
 
 
425 aa  259  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000369055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  37.84 
 
 
392 aa  259  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  38.92 
 
 
392 aa  259  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0790  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.41 
 
 
433 aa  258  9e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.94 
 
 
396 aa  258  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  34.23 
 
 
390 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.59 
 
 
402 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.43 
 
 
403 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1040  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.32 
 
 
448 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0244331  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.69 
 
 
403 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  41.65 
 
 
389 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.69 
 
 
403 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.84 
 
 
394 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  38.92 
 
 
397 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>