262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7929 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  100 
 
 
251 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  76.4 
 
 
251 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  73.66 
 
 
259 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  72.06 
 
 
253 aa  353  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  72.58 
 
 
251 aa  342  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  67.36 
 
 
269 aa  330  9e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  70.04 
 
 
251 aa  321  8e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  65.29 
 
 
259 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  65.7 
 
 
259 aa  317  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  65.7 
 
 
259 aa  317  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  65.98 
 
 
260 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  65.57 
 
 
260 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  62.81 
 
 
260 aa  304  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  59.35 
 
 
258 aa  295  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  58.14 
 
 
277 aa  290  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  56.61 
 
 
256 aa  281  9e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  51.24 
 
 
271 aa  230  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  40.98 
 
 
291 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  44.03 
 
 
261 aa  181  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  36.51 
 
 
264 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  36.8 
 
 
270 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  38.15 
 
 
271 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  37.05 
 
 
274 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  34 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  36.4 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  35.48 
 
 
274 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  34.68 
 
 
274 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  39.83 
 
 
281 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  37.4 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  34.68 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  36.33 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  36.8 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  36.99 
 
 
255 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  34.96 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  36.18 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  36 
 
 
286 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  35.63 
 
 
590 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  32.02 
 
 
278 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  38.89 
 
 
291 aa  99.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  35.37 
 
 
243 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  34.87 
 
 
286 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  35.39 
 
 
243 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  31.84 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  30.27 
 
 
312 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  34.39 
 
 
266 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  32.54 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  32.16 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  29.84 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  29.8 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  38.06 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  38.04 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  35.8 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  30.33 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  37.42 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  30.04 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  27.98 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  33.54 
 
 
255 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  33.72 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  27.8 
 
 
599 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  31.02 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  30.61 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  26 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  26.77 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  27.11 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  27.98 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  31.01 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.45 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.76 
 
 
216 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  28.35 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.95 
 
 
214 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.07 
 
 
213 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.07 
 
 
213 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  30.04 
 
 
209 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.24 
 
 
212 aa  62.4  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  28.76 
 
 
212 aa  62  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  29.86 
 
 
667 aa  62  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  26.34 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.62 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  26.34 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  26.34 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2491  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.76 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000498099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.75 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.75 
 
 
213 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.11 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.31 
 
 
212 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.95 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3846  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.11 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  25.64 
 
 
213 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  24.78 
 
 
463 aa  58.5  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  27.73 
 
 
213 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  30.07 
 
 
663 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  29.96 
 
 
648 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.2 
 
 
216 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3126  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.94 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.859515  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  27.9 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  29.07 
 
 
202 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.32 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.27 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  33.33 
 
 
663 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  27.6 
 
 
669 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>