More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7844 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
255 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  42.19 
 
 
268 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  41.02 
 
 
248 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  40.6 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.47 
 
 
252 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  32.52 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  32.52 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1565  transcriptional regulator, DeoR family  35.37 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.02 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  40.17 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.61 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.02 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.52 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.52 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  36.95 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.61 
 
 
252 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.52 
 
 
252 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.52 
 
 
252 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.52 
 
 
252 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  35.69 
 
 
252 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  33.46 
 
 
253 aa  131  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.238467 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  32.52 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.11 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  39.81 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  37.2 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  38.24 
 
 
251 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  37.15 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  33.62 
 
 
247 aa  128  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  39.35 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  34.19 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.65 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  37.6 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.65 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.65 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.65 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  34.03 
 
 
257 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  38.14 
 
 
251 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  37.87 
 
 
253 aa  126  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  37.96 
 
 
254 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  32.93 
 
 
254 aa  125  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  35.42 
 
 
257 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.45 
 
 
258 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  38.66 
 
 
256 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  36.55 
 
 
260 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  41.86 
 
 
254 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
257 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  37.85 
 
 
259 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
252 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  38.4 
 
 
254 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
242 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
254 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  32.64 
 
 
255 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  35.44 
 
 
251 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  38.59 
 
 
255 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  34.6 
 
 
259 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
258 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  34.6 
 
 
257 aa  122  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  34.6 
 
 
257 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  34.6 
 
 
257 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  34.6 
 
 
259 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
257 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.58 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.58 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.49 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  37.77 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  33.19 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
261 aa  119  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  33.19 
 
 
257 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  36.4 
 
 
265 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  33.19 
 
 
257 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  32.38 
 
 
263 aa  119  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  32.14 
 
 
263 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  33.19 
 
 
257 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  33.19 
 
 
257 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3731  regulatory protein, DeoR  31.98 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
266 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2235  DeoR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
259 aa  118  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859699  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  37.89 
 
 
252 aa  118  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.52 
 
 
258 aa  118  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  31.51 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.61 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  37.61 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  34.17 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  31.4 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>