More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2001 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 262 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.85 
 
 		 261 aa  346  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.31 
 
 		 260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.628756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.21 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.11 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.76 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4180  putative oxidoreductase  51.36 
 
 		 260 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.66264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.52 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104801  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  49.25 
 
 		 268 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.69 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  48.69 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.06 
 
 		 262 aa  211  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.31 
 
 		 261 aa  195  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.42 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  40.45 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5718  short chain dehydrogenase  43.51 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  39.25 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5339  short chain dehydrogenase  43.13 
 
 		 264 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5428  short chain dehydrogenase  43.13 
 
 		 264 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.819965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  39.08 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 264 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5918  short chain dehydrogenase  42.31 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0943  short chain dehydrogenase  40.86 
 
 		 264 aa  148  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3349  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5172  short chain dehydrogenase  39.63 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4577  short chain dehydrogenase  36.74 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.795837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0350  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4368  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.494566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3998  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219529  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0279  short chain dehydrogenase  34.46 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946845  normal  0.64471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0058487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0339  short chain dehydrogenase  37.92 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4563  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332785  normal  0.123242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.328906 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.21 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849421 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.25 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2190  short chain dehydrogenase  41 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.7 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 		 247 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.06 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  35.58 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  36.57 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3525  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 		 259 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  35.21 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5382  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.712878 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  35.21 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  35.21 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  35.21 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  33.46 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3138  oxidoreductase protein  38.18 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  36.92 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  35.04 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00172962  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4622  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.851754  normal  0.710684 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  34.83 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0585429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 		 246 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4238  short chain dehydrogenase  32.25 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.83 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  33.83 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 263 aa  122  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 250 aa  121  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>