More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0104 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0104  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1056 aa  2140    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4289  acriflavin resistance protein  89.1 
 
 		 1055 aa  1838    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2405  acriflavin resistance protein  52.58 
 
 		 1051 aa  1087    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4429  acriflavin resistance protein  89.3 
 
 		 1059 aa  1843    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0111  acriflavin resistance protein  89.3 
 
 		 1059 aa  1812    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6349  acriflavin resistance protein  34.86 
 
 		 1064 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2381  acriflavin resistance protein D  34.29 
 
 		 1092 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.422424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0835  acriflavin resistance protein  34.73 
 
 		 1042 aa  589  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181435  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0917  acriflavin resistance protein  34.71 
 
 		 1054 aa  533  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1961  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.58 
 
 		 1038 aa  512  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4767  acriflavin resistance protein  29.93 
 
 		 1037 aa  492  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300742  unclonable  0.0000000523741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4375  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 		 1038 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000150121  normal  0.679218 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0044  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1036 aa  480  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0140  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1026 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2667  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.85 
 
 		 1035 aa  478  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3430  acriflavin resistance protein  30.77 
 
 		 1037 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1475  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 		 1027 aa  455  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.521845  normal  0.0685081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3672  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1061 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3726  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1061 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.226552 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1050 aa  346  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1044 aa  335  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.88 
 
 		 1023 aa  327  8.000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  24.4 
 
 		 1011 aa  327  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  24.51 
 
 		 1043 aa  324  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.84 
 
 		 1044 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.66 
 
 		 1049 aa  317  6e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3737  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 		 1014 aa  311  4e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  24.25 
 
 		 1058 aa  308  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1017 aa  308  5.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1031 aa  307  8.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1031 aa  307  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1031 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1041 aa  305  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1031 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1031 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.21 
 
 		 1031 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.96 
 
 		 1034 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1031 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1031 aa  303  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1040 aa  302  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  25.31 
 
 		 1031 aa  303  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 		 1040 aa  302  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1083 aa  301  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  24.06 
 
 		 1068 aa  301  6e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 1030 aa  300  9e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  23.38 
 
 		 1034 aa  299  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  24.17 
 
 		 1034 aa  300  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  24.46 
 
 		 1038 aa  298  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 1029 aa  298  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1087 aa  297  6e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  23.67 
 
 		 1036 aa  297  7e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  27.73 
 
 		 1027 aa  296  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  24.95 
 
 		 1034 aa  295  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  24.8 
 
 		 1092 aa  295  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 		 1042 aa  295  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  25.97 
 
 		 1037 aa  294  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  24.45 
 
 		 1031 aa  294  7e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1027 aa  293  8e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1031 aa  293  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1069 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  24.38 
 
 		 1034 aa  290  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  23.73 
 
 		 1040 aa  289  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  24.78 
 
 		 1058 aa  287  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.03 
 
 		 1024 aa  287  9e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01699  RND family efflux transporter  25.42 
 
 		 1038 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  25.93 
 
 		 1035 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  24.78 
 
 		 1042 aa  286  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  24.35 
 
 		 1071 aa  283  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  25.15 
 
 		 1039 aa  283  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  24.34 
 
 		 1031 aa  282  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  24.69 
 
 		 1060 aa  283  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  24.09 
 
 		 1040 aa  282  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  24.15 
 
 		 1059 aa  282  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0306  RND efflux transporter  25.02 
 
 		 1044 aa  283  2e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  24.48 
 
 		 1055 aa  283  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  23.9 
 
 		 1063 aa  282  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.29 
 
 		 1024 aa  281  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  25.22 
 
 		 1037 aa  281  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  24.33 
 
 		 1031 aa  281  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1038 aa  281  5e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  24.78 
 
 		 1014 aa  281  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1009 aa  280  8e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1036 aa  280  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  24.26 
 
 		 1039 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.87 
 
 		 1122 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  24.21 
 
 		 1070 aa  276  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0629  acriflavin resistance protein  24.59 
 
 		 1014 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1044 aa  276  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0629  acriflavin resistance protein  24.49 
 
 		 1014 aa  275  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0312217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1046 aa  275  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  24.28 
 
 		 1095 aa  275  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  24.55 
 
 		 1087 aa  274  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0606  acriflavin resistance protein  24.09 
 
 		 1014 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0459502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0685  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  24.3 
 
 		 1014 aa  274  6e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0719  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  24.3 
 
 		 1014 aa  274  6e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  23.84 
 
 		 1065 aa  274  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  22.48 
 
 		 1041 aa  271  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3825  acriflavin resistance protein  25.35 
 
 		 1036 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0847  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  24.3 
 
 		 1014 aa  271  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000146243  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  24.5 
 
 		 1048 aa  271  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>