More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4646 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03283  glycogen debranching enzyme  62.82 
 
 		 657 aa  864    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000400543  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0283  glycogen debranching enzyme GlgX  62.82 
 
 		 657 aa  864    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0224  glycogen debranching enzyme  62.88 
 
 		 656 aa  849    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3910  glycogen debranching enzyme  62.82 
 
 		 657 aa  863    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3893  glycogen debranching enzyme  62.82 
 
 		 657 aa  863    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0148  glycogen debranching enzyme  67.17 
 
 		 662 aa  899    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4743  glycogen debranching enzyme  62.82 
 
 		 657 aa  865    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3727  glycogen debranching enzyme  63.43 
 
 		 658 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3713  glycogen debranching enzyme  62.52 
 
 		 657 aa  860    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.723997  normal  0.535779 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3631  glycogen debranching enzyme  62.67 
 
 		 657 aa  862    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03236  hypothetical protein  62.82 
 
 		 657 aa  864    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00116729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0278  glycogen debranching enzyme  61.97 
 
 		 655 aa  843    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3907  glycogen debranching enzyme  63.58 
 
 		 658 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.385353  normal  0.48763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3804  glycogen debranching enzyme  63.88 
 
 		 658 aa  868    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3738  glycogen debranching enzyme  63.43 
 
 		 658 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3839  glycogen debranching enzyme  62.24 
 
 		 657 aa  848    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.90909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3936  glycogen debranching enzyme  66.97 
 
 		 658 aa  890    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3846  glycogen debranching enzyme  63.73 
 
 		 658 aa  866    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.825937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4005  glycogen debranching enzyme  67.02 
 
 		 662 aa  898    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4135  glycogen debranching enzyme  66.97 
 
 		 658 aa  883    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4119  glycogen debranching enzyme  66.87 
 
 		 662 aa  896    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.548863 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4646  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 661 aa  1360    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.298898 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0281  glycogen debranching enzyme  62.67 
 
 		 657 aa  862    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00281975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  49.56 
 
 		 710 aa  629  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  48.94 
 
 		 706 aa  626  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  47.34 
 
 		 704 aa  622  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0888  glycogen operon protein  49.85 
 
 		 660 aa  615  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  47.88 
 
 		 707 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  47.58 
 
 		 708 aa  608  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  48.43 
 
 		 720 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  47.02 
 
 		 720 aa  607  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  49.32 
 
 		 701 aa  600  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  46.81 
 
 		 720 aa  597  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  48.7 
 
 		 719 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  49.92 
 
 		 727 aa  597  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  45.8 
 
 		 712 aa  595  1e-169  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  47.74 
 
 		 1537 aa  595  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  47.9 
 
 		 706 aa  593  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  48.78 
 
 		 709 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  46.44 
 
 		 751 aa  592  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  48.33 
 
 		 700 aa  593  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  45.27 
 
 		 726 aa  592  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  46.65 
 
 		 718 aa  591  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  47.65 
 
 		 701 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  48.92 
 
 		 755 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  49.1 
 
 		 733 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  47.87 
 
 		 701 aa  588  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  44.75 
 
 		 720 aa  590  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  46.66 
 
 		 707 aa  588  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  47.12 
 
 		 755 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1103  glycogen debranching enzyme GlgX  49.24 
 
 		 695 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.512458 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  46.74 
 
 		 723 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  45.6 
 
 		 758 aa  586  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  45.79 
 
 		 721 aa  585  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  48.85 
 
 		 701 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  47.01 
 
 		 738 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  48.92 
 
 		 779 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  48.46 
 
 		 757 aa  588  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  48.41 
 
 		 716 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  47.09 
 
 		 738 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  46.43 
 
 		 723 aa  587  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  45.6 
 
 		 758 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  46.03 
 
 		 727 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  48.62 
 
 		 708 aa  584  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  47.95 
 
 		 716 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  47.22 
 
 		 733 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  50 
 
 		 719 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  48.16 
 
 		 703 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  46.11 
 
 		 727 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  46.05 
 
 		 714 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  46.81 
 
 		 730 aa  579  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  48.62 
 
 		 712 aa  581  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0515  glycogen debranching protein GlgX  48.43 
 
 		 739 aa  579  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  47.88 
 
 		 710 aa  578  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  46.41 
 
 		 721 aa  579  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  46.81 
 
 		 692 aa  581  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  46.05 
 
 		 714 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  46.05 
 
 		 714 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  46.97 
 
 		 756 aa  581  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  47.98 
 
 		 754 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  44.46 
 
 		 710 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4166  glycogen debranching enzyme GlgX  48.15 
 
 		 693 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.830683  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  48.26 
 
 		 704 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  45.54 
 
 		 713 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  47.5 
 
 		 729 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  45.76 
 
 		 752 aa  578  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  46.53 
 
 		 711 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  47.66 
 
 		 745 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  47.8 
 
 		 720 aa  578  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  46.53 
 
 		 711 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  49.6 
 
 		 733 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0537  glycogen debranching enzyme GlgX  47.54 
 
 		 695 aa  577  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  49.68 
 
 		 704 aa  572  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1672  glycogen debranching enzyme GlgX  47.04 
 
 		 691 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.574762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  52.23 
 
 		 776 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  46.54 
 
 		 691 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  48.54 
 
 		 692 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1607  glycogen debranching enzyme GlgX  47.19 
 
 		 691 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1463  glycogen debranching enzyme GlgX  47.44 
 
 		 708 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.66197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1785  glycogen debranching enzyme GlgX  47.04 
 
 		 691 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>