More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2912 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2912  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.421482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2060  ABC transporter related  70.59 
 
 		 228 aa  308  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.558102 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  61.26 
 
 		 238 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  60.81 
 
 		 238 aa  257  9e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  60.81 
 
 		 238 aa  257  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1762  ABC transporter related  57.21 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  61.09 
 
 		 234 aa  251  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1798  ABC transporter related  58.72 
 
 		 227 aa  244  9e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0803004  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  57.27 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  55.56 
 
 		 247 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  54.5 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  50.9 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  50.45 
 
 		 262 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  50.67 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  50.45 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  47.51 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  51.36 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  51.12 
 
 		 249 aa  207  8e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  50.91 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  50 
 
 		 252 aa  204  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  50 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  50.24 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  49.31 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  49.09 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  49.55 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  49.56 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  50.44 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  50.44 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  50.44 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  49.55 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  50.45 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  50.44 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  48.64 
 
 		 260 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  48.86 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  53.43 
 
 		 255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  48.4 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  52.28 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  50 
 
 		 258 aa  198  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  198  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  49.32 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  48.2 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  49.55 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  49.12 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  46.61 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  47.06 
 
 		 254 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  49.55 
 
 		 247 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  48.18 
 
 		 255 aa  194  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  47.96 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  52.5 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  47.93 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.95 
 
 		 327 aa  185  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  40.6 
 
 		 308 aa  184  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  48.64 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  45.15 
 
 		 565 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.38 
 
 		 347 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7187  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.22 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  41.2 
 
 		 308 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 308 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1234  ABC transporter related  42.92 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.83 
 
 		 329 aa  178  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.471661  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3783  ABC transporter related  45.85 
 
 		 328 aa  178  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  44.83 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0463  ABC transporter related  43.3 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5508  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  43.63 
 
 		 355 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.444532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  45.32 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 		 308 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 308 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 308 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 		 308 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0506  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.87 
 
 		 340 aa  176  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.408902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 308 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 		 571 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.36 
 
 		 676 aa  176  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  42.48 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  42.86 
 
 		 561 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1586  ABC transporter related  43.63 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159648  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  43.53 
 
 		 571 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1686  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.28 
 
 		 340 aa  175  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.62904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0500  ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 		 328 aa  175  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  44.13 
 
 		 575 aa  174  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5440  ABC transporter related  45.81 
 
 		 285 aa  174  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0876  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  43.91 
 
 		 345 aa  174  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.08 
 
 		 370 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0906  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  45.07 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0105903  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2773  ABC transporter related  41.52 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.53 
 
 		 571 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0878  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.9 
 
 		 322 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.17 
 
 		 326 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.76 
 
 		 566 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3547  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.41 
 
 		 426 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>