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for query gene Spro_2193 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2193  inner membrane transport protein YdhC  100 
 
 
402 aa  800    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.230534  hitchhiker  0.00000667038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1859  inner membrane transport protein YdhC  79.27 
 
 
400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1753  inner membrane transport protein YdhC  79.27 
 
 
400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000133845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2574  inner membrane transport protein YdhC  79 
 
 
400 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723156  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01631  predicted transporter  62.87 
 
 
403 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  62.62 
 
 
403 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  62.87 
 
 
403 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  62.87 
 
 
403 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  62.87 
 
 
403 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1858  inner membrane transport protein YdhC  62.87 
 
 
403 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141458  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  62.87 
 
 
403 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1537  inner membrane transport protein YdhC  62.62 
 
 
403 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0900835  normal  0.0201427 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  62.87 
 
 
403 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1787  inner membrane transport protein YdhC  61.85 
 
 
399 aa  490  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1538  inner membrane transport protein YdhC  62.59 
 
 
401 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0173263  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1915  inner membrane transport protein YdhC  62.84 
 
 
401 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.04399  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1561  inner membrane transport protein YdhC  62.84 
 
 
401 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00165154  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1524  inner membrane transport protein YdhC  62.59 
 
 
401 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1746  inner membrane transport protein YdhC  62.84 
 
 
401 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000953992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2001  inner membrane transport protein YdhC  43.01 
 
 
423 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.330416  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1975  inner membrane transport protein YdhC  42.48 
 
 
423 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00432346  normal  0.238152 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2062  inner membrane transport protein YdhC  42.56 
 
 
423 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0300208  hitchhiker  0.0000445081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2138  inner membrane transport protein YdhC  44.6 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.030791  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2373  inner membrane transport protein YdhC  43.72 
 
 
423 aa  280  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2311  inner membrane transport protein YdhC  42.64 
 
 
423 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216874  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1784  inner membrane transport protein YdhC  39.71 
 
 
433 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2203  inner membrane transport protein YdhC  42.82 
 
 
423 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00024069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2168  inner membrane transport protein YdhC  42.82 
 
 
423 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00660024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2471  inner membrane transport protein YdhC  40.83 
 
 
419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000730777  hitchhiker  0.00484475 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2203  inner membrane transport protein YdhC  42.82 
 
 
423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000782097  normal  0.105834 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1999  inner membrane transport protein YdhC  42.3 
 
 
424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00228821  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0922  inner membrane transport protein YdhC  40.92 
 
 
427 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00416  inner membrane transport protein YdhC  40 
 
 
401 aa  263  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2113  inner membrane transport protein YdhC  43.43 
 
 
414 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0214399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002035  multidrug resistance protein  39.75 
 
 
401 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2531  inner membrane transport protein YdhC  43.9 
 
 
400 aa  259  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2012  inner membrane transport protein YdhC  43.9 
 
 
430 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000383533  normal  0.0277688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.58 
 
 
392 aa  159  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.12 
 
 
409 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.78 
 
 
420 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 
394 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.38 
 
 
409 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  32.22 
 
 
420 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  31.15 
 
 
426 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.37 
 
 
409 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  31.46 
 
 
407 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.67 
 
 
403 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.87 
 
 
405 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.34 
 
 
458 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.87 
 
 
434 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.34 
 
 
405 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.34 
 
 
405 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.34 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.99 
 
 
401 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.4 
 
 
405 aa  139  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.65 
 
 
405 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.88 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.34 
 
 
405 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.02 
 
 
394 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  31.65 
 
 
404 aa  136  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  30.14 
 
 
426 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.5 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.02 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.35 
 
 
400 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.39 
 
 
399 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.39 
 
 
401 aa  133  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.18 
 
 
396 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.42 
 
 
400 aa  133  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.05 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.14 
 
 
399 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.19 
 
 
498 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.11 
 
 
393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.39 
 
 
424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.04 
 
 
412 aa  130  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  31.27 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.55 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.26 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.03 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  31.9 
 
 
393 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.9 
 
 
393 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.09 
 
 
400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.06 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.06 
 
 
411 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.22 
 
 
417 aa  127  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.9 
 
 
411 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
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NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.47 
 
 
400 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.47 
 
 
400 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.47 
 
 
400 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.47 
 
 
400 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.47 
 
 
411 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.47 
 
 
411 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.64 
 
 
418 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_4159  MFS permease  28.41 
 
 
392 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.94 
 
 
409 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  33.06 
 
 
411 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.55 
 
 
399 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.43 
 
 
401 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.05 
 
 
399 aa  124  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
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NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.33 
 
 
465 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
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