167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1571 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  100 
 
 		 407 aa  805    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  64.65 
 
 		 393 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  64.9 
 
 		 393 aa  491  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  64.9 
 
 		 393 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 		 392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  43.15 
 
 		 404 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 392 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  39.47 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  40.11 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  40.11 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  40.11 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  39.39 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  39.39 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  37.96 
 
 		 397 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  39.11 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 		 395 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  39.11 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  39.11 
 
 		 395 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  38.83 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  39.11 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  35.81 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  30.08 
 
 		 405 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  26.55 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  26.38 
 
 		 412 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  26.87 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  27.13 
 
 		 412 aa  140  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  25.93 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 417 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  26.59 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  24.82 
 
 		 442 aa  99.8  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 464 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 460 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 460 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 464 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  25.3 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 450 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.13 
 
 		 424 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  25.06 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  25.06 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  25.06 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  25.06 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.31 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.37 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.44 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.93 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  25.13 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  25 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  23.63 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  23.81 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  21.99 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  24.68 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  24.56 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.68 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  24.68 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  24.68 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  24.56 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  22.47 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  23.45 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  23.45 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  22.42 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2097  transporter, putative  24.18 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  21.14 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  21.14 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  23.44 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  22.1 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  20.95 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  20.97 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  20.49 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  23.6 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>