More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1035 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1035  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5596  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.8 
 
 		 235 aa  350  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0283  two component transcriptional regulator  74.39 
 
 		 243 aa  345  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126158 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4102  DNA-binding response regulator  73.22 
 
 		 239 aa  343  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0131  two component transcriptional regulator  71.9 
 
 		 245 aa  335  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364585  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4024  DNA-binding response regulator  71.9 
 
 		 245 aa  335  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  44.68 
 
 		 245 aa  198  5e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  44.68 
 
 		 245 aa  198  6e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  45.71 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.83 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.15 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  41.95 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  42.44 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  42.37 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  42.26 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.57 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 261 aa  175  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  41.95 
 
 		 238 aa  174  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  43.16 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.33 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  42.32 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  42.32 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  39.24 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.35 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  41.88 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  42.13 
 
 		 236 aa  171  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  41.49 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.24 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.42 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.78 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 240 aa  168  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  40.59 
 
 		 241 aa  168  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  41.91 
 
 		 238 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  41.91 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  39.24 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 249 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  39.24 
 
 		 241 aa  165  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0207  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.92 
 
 		 262 aa  165  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00814931  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.75 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  39.75 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.75 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0872  DNA-binding response regulator  41.53 
 
 		 244 aa  165  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  39.66 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  41.49 
 
 		 238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  39.92 
 
 		 240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0786  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1820  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2103  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0666731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  42.44 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  39.24 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  39.24 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0577  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  41.88 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  38.56 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  38.46 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5598  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 249 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122257  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5962  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 249 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2783  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  40.76 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.92 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4261  DNA-binding response regulator  37.92 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6462  two component transcriptional regulator  42.19 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.747199 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  40.57 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  40.93 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  39.32 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.26 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2121  DNA-binding response regulator  40.68 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0885999  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0602  DNA-binding response regulator  40.68 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  39.26 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  39.26 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0746  DNA-binding response regulator  40.68 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  39.26 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  39.26 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0531  DNA-binding response regulator  40.68 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1669  DNA-binding response regulator  40.68 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.501573  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  39.26 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  39.26 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  39.26 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2023  DNA-binding response regulator  40.68 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485022  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  41.42 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  40.41 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  39.43 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  39.26 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>