101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3432 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
191 aa  370  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  45.77 
 
 
166 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  45.77 
 
 
166 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  44.53 
 
 
166 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  40.26 
 
 
157 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  36.36 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  38.31 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  39.39 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  38.17 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  31.1 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1054  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.402831 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0936  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  35.14 
 
 
157 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  35.14 
 
 
157 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  31.93 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  32.88 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  32.3 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2591  hydrogenase maturation protease  43.85 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.584226  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  33.33 
 
 
160 aa  58.9  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3969  hydrogenase maturation protease  34.78 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000953733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  35.92 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2386  hypothetical protein  25.5 
 
 
159 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.57 
 
 
174 aa  55.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  31.79 
 
 
169 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2531  hypothetical protein  26.17 
 
 
159 aa  54.7  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  32.03 
 
 
157 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  31.33 
 
 
166 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34 
 
 
188 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3881  hydrogenase maturation protease  32.17 
 
 
156 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  29.2 
 
 
160 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3323  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.81 
 
 
154 aa  52.4  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  26.88 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  26.9 
 
 
160 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 
178 aa  52  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  29.29 
 
 
156 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  33.79 
 
 
165 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  26.9 
 
 
160 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  30.86 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  32.87 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  31.34 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2138  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.36 
 
 
137 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.577863  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  34.15 
 
 
170 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2184  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.36 
 
 
137 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2409  hydrogenase maturation protease  35.61 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  33.86 
 
 
161 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  32.84 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  30.88 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  25.17 
 
 
160 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  29.25 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  26.24 
 
 
152 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  29.33 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  31.72 
 
 
271 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  31.94 
 
 
257 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  27.97 
 
 
172 aa  48.5  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  29.45 
 
 
172 aa  48.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  28.37 
 
 
159 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  27.07 
 
 
157 aa  48.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  25.53 
 
 
194 aa  47.8  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  29.17 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  26.67 
 
 
159 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  31.94 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3681  hydrogenase maturation protease  35.03 
 
 
163 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.157783  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2103  hydrogenase maturation protease  25.35 
 
 
159 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.95 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  29.61 
 
 
173 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  29.66 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4291  hydrogenase maturation protease  37.1 
 
 
171 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  26.45 
 
 
167 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  28 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  26.85 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4313  hydrogenase maturation protease  37.1 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  28.77 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.38 
 
 
153 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  23.46 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  28.87 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  27.74 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  28.17 
 
 
206 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  24.29 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.45 
 
 
164 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.45 
 
 
164 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  26.45 
 
 
164 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.45 
 
 
164 aa  42.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  26.45 
 
 
164 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  26.45 
 
 
164 aa  42  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.45 
 
 
164 aa  42  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.45 
 
 
164 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.45 
 
 
164 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  27.22 
 
 
157 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08520  hydrogenase maturation protease  25 
 
 
175 aa  42  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  28.79 
 
 
144 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  26.81 
 
 
160 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.45 
 
 
164 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.45 
 
 
164 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.45 
 
 
164 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.45 
 
 
164 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.45 
 
 
164 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  28.47 
 
 
168 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4161  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.29 
 
 
156 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>