More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2834 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 
488 aa  989    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  63.71 
 
 
482 aa  617  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  56.49 
 
 
524 aa  481  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  42.94 
 
 
530 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  47.2 
 
 
503 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  44.49 
 
 
505 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  46.06 
 
 
502 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  46.82 
 
 
498 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  38.35 
 
 
508 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  40.72 
 
 
493 aa  296  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  35.95 
 
 
462 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  36.97 
 
 
468 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  36.42 
 
 
467 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  34.43 
 
 
468 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  36.42 
 
 
467 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  36.42 
 
 
467 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  36.42 
 
 
467 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  36.02 
 
 
477 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  36.22 
 
 
467 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  36.69 
 
 
476 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  37.6 
 
 
472 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  35.37 
 
 
469 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  36.18 
 
 
479 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  36.13 
 
 
479 aa  246  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  36.34 
 
 
469 aa  243  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  36.29 
 
 
469 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  35.28 
 
 
474 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  35.69 
 
 
469 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  34.79 
 
 
474 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  34.07 
 
 
479 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  35.33 
 
 
465 aa  238  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  35.01 
 
 
469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  35.81 
 
 
469 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  35.15 
 
 
470 aa  230  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  35.54 
 
 
471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  34.79 
 
 
486 aa  223  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.7 
 
 
488 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  32.78 
 
 
457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  31.38 
 
 
485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  31.71 
 
 
589 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  28.74 
 
 
597 aa  149  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  31.21 
 
 
477 aa  148  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  29.36 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.93 
 
 
493 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  30.63 
 
 
591 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  31.89 
 
 
631 aa  140  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  30.51 
 
 
588 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  30.45 
 
 
598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  30.24 
 
 
589 aa  133  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.43 
 
 
510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.26 
 
 
616 aa  131  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  28.83 
 
 
434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  28.54 
 
 
598 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.88 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  29.63 
 
 
598 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  27.89 
 
 
591 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  30.94 
 
 
483 aa  126  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  26.88 
 
 
637 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  26.93 
 
 
608 aa  123  7e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.06 
 
 
509 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  27.66 
 
 
609 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  30.46 
 
 
596 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.82 
 
 
491 aa  120  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.26 
 
 
502 aa  119  9e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.37 
 
 
586 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0850069  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0232  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.79 
 
 
523 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0397857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  27.51 
 
 
582 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1543  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 
584 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.603101  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.74 
 
 
578 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  29.78 
 
 
650 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0465  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.7 
 
 
524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  26.88 
 
 
599 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.85 
 
 
476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  30.08 
 
 
596 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  28.19 
 
 
596 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.76 
 
 
470 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  28.22 
 
 
596 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4567  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  32.94 
 
 
566 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420272  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2868  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  31.71 
 
 
558 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22099  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3175  tricarballylate dehydrogenase  29.71 
 
 
441 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4662  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.65 
 
 
563 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4750  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.65 
 
 
563 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309954  normal  0.275452 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  27.3 
 
 
1004 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2884  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.61 
 
 
557 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.097907  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.05 
 
 
509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  28.48 
 
 
596 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  28.91 
 
 
616 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  26.8 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5045  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.48 
 
 
563 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  30.06 
 
 
596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  27.74 
 
 
583 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2427  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.94 
 
 
599 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.250716 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  28.22 
 
 
596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3358  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.64 
 
 
564 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.7 
 
 
596 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3521  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.34 
 
 
559 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  30.06 
 
 
596 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0355  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  29.63 
 
 
471 aa  114  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0462  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.71 
 
 
536 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  25.64 
 
 
584 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>