More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2082 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  100 
 
 
575 aa  1134    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  50.71 
 
 
564 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  46.85 
 
 
574 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  50 
 
 
578 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  45.76 
 
 
570 aa  468  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1127  ABC transporter transmembrane region  50.79 
 
 
580 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  45.94 
 
 
593 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.38 
 
 
588 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  40.27 
 
 
615 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  44.54 
 
 
619 aa  371  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.55 
 
 
607 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  38.28 
 
 
612 aa  352  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4196  ABC transporter transmembrane region  40.17 
 
 
580 aa  350  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00643785  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  36.88 
 
 
589 aa  344  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  38.46 
 
 
578 aa  340  5e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.58 
 
 
564 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01280  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.88 
 
 
530 aa  176  9e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  32 
 
 
570 aa  171  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  34.23 
 
 
549 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  31.21 
 
 
575 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  27.78 
 
 
633 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  30.29 
 
 
566 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  29.9 
 
 
584 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3689  ABC transporter related protein  31.47 
 
 
560 aa  154  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  28.41 
 
 
641 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  28.34 
 
 
634 aa  150  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  25.47 
 
 
608 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  27.6 
 
 
650 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  27.6 
 
 
650 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  22.81 
 
 
609 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.56 
 
 
583 aa  144  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003428  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  26.97 
 
 
554 aa  144  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000488495  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.94 
 
 
582 aa  143  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  26.34 
 
 
583 aa  143  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  22.82 
 
 
597 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  22.62 
 
 
592 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.11 
 
 
582 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  25.93 
 
 
607 aa  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  22.94 
 
 
575 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  24.02 
 
 
626 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  28.54 
 
 
585 aa  137  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  23.94 
 
 
566 aa  137  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  25.93 
 
 
574 aa  137  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  24.34 
 
 
598 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.21 
 
 
610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.44 
 
 
582 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02349  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 
598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  27.93 
 
 
612 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1316  lipid/multidrug ABC transporter MsbA ATPase and inner membrane domains  26.51 
 
 
595 aa  135  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  23.95 
 
 
594 aa  135  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.83 
 
 
574 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.83 
 
 
574 aa  134  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  26.72 
 
 
583 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.71 
 
 
579 aa  133  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1062  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.74 
 
 
598 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.94 
 
 
582 aa  133  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.12 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  26.64 
 
 
600 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.01 
 
 
589 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.12 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.49 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.49 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.12 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.82 
 
 
583 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.49 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.49 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.49 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  25.98 
 
 
610 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.98 
 
 
609 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  24.57 
 
 
587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  23.26 
 
 
625 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0885  ABC transporter related protein  25.76 
 
 
590 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  25.44 
 
 
671 aa  131  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  25.41 
 
 
582 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.41 
 
 
582 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.41 
 
 
582 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.41 
 
 
582 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  25.41 
 
 
582 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37360  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.05 
 
 
619 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.41 
 
 
582 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  22.71 
 
 
613 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.41 
 
 
582 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.41 
 
 
582 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.41 
 
 
582 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.54 
 
 
608 aa  130  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  25.06 
 
 
580 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  26.45 
 
 
578 aa  130  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  23.13 
 
 
584 aa  130  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  24.74 
 
 
589 aa  130  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  24.72 
 
 
631 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  25.95 
 
 
579 aa  130  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  27.21 
 
 
603 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  22.16 
 
 
583 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  25.14 
 
 
608 aa  130  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1770  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.16 
 
 
607 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0549134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.74 
 
 
583 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.24 
 
 
597 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  25.46 
 
 
638 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  26.77 
 
 
640 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>