More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1909 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  76.24 
 
 		 469 aa  711    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  100 
 
 		 471 aa  950    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  53.91 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  55.19 
 
 		 504 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  51.75 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  48.78 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  49 
 
 		 469 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  49 
 
 		 469 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  50.44 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  43.46 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4085  Amidase  51.2 
 
 		 469 aa  360  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  46.52 
 
 		 468 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  46.37 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  42.18 
 
 		 471 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  46 
 
 		 469 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  44.17 
 
 		 478 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3137  amidase  42.54 
 
 		 491 aa  296  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  42.67 
 
 		 474 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  41.5 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  41.72 
 
 		 469 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  37.93 
 
 		 483 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  38.21 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3815  amidase  40.7 
 
 		 471 aa  276  7e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000420509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3371  amidase  41.28 
 
 		 469 aa  272  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  40.48 
 
 		 471 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  40.92 
 
 		 474 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  41.09 
 
 		 473 aa  263  6e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  36.78 
 
 		 477 aa  262  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  38.06 
 
 		 475 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  40 
 
 		 471 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  40.92 
 
 		 458 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  39.57 
 
 		 475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  39.08 
 
 		 467 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  36.78 
 
 		 472 aa  246  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  36.11 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  37.5 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  37.42 
 
 		 470 aa  239  8e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  34.23 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  35.56 
 
 		 486 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  35.73 
 
 		 464 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  35.51 
 
 		 464 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  35.51 
 
 		 464 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2842  amidase  37.07 
 
 		 477 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.34 
 
 		 484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  34.7 
 
 		 475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  36.06 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  33.69 
 
 		 475 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  34.83 
 
 		 473 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1864  amidase  35.08 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3526  amidase  36.76 
 
 		 490 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3170  amidase  36.76 
 
 		 490 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.43381 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1098  amidase  35.08 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  34.05 
 
 		 494 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  33.69 
 
 		 494 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2125  amidase  35.57 
 
 		 471 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  35.1 
 
 		 499 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  34.11 
 
 		 494 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  34.74 
 
 		 482 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  36.76 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  33.33 
 
 		 494 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5442  amidase  37.05 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2205  amidase  38.93 
 
 		 484 aa  213  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  35.73 
 
 		 495 aa  212  9e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  33.55 
 
 		 494 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  33.55 
 
 		 494 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.23 
 
 		 479 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  33.55 
 
 		 494 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1032  amidase  35.14 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0140  amidase  37.67 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  36.07 
 
 		 463 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  34.88 
 
 		 477 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  34.27 
 
 		 485 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4356  amidase  36.8 
 
 		 472 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0637971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  38.38 
 
 		 477 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  35.63 
 
 		 464 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  37.82 
 
 		 470 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  35.52 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  36.13 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  37.37 
 
 		 461 aa  204  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0381  amidase  34.86 
 
 		 464 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0768  amidase  34.86 
 
 		 464 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0886  amidase  39.1 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  35.62 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0815  amidase  38.89 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4488  amidase  34.34 
 
 		 463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3296  amidase  33.99 
 
 		 471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297102  normal  0.0238145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  33.83 
 
 		 494 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  33.75 
 
 		 496 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  36.21 
 
 		 492 aa  200  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.89 
 
 		 485 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5261  amidase  36.58 
 
 		 473 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503893  normal  0.344204 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  33.4 
 
 		 549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  31.37 
 
 		 495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  34.11 
 
 		 459 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5648  amidase  33.33 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0454  amidase  37.47 
 
 		 471 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.61 
 
 		 485 aa  195  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3929  amidase  35.36 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  33.26 
 
 		 490 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  33.33 
 
 		 497 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>