143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5255 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  85.2 
 
 		 196 aa  322  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  73.98 
 
 		 196 aa  316  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  51.5 
 
 		 236 aa  204  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  41.21 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  41.5 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  41.21 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  40.2 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  36.89 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  30.81 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2283  hypothetical protein  34.96 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  30.14 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  31.22 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  28.71 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  35.96 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  35.45 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  36.92 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  36.27 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  35.29 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  28.44 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  34.21 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  30.39 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  30.07 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  26.46 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  28.38 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  28.23 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  31.61 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  27.73 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  28.81 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  29.58 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  28.06 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  30.51 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  32.04 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  33.07 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  31.67 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  29.05 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2541  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30.58 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1319  hypothetical protein  28.92 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.104024  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  28.77 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  31.43 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  28.65 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3234  hypothetical protein  27.1 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  27.27 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2637  protein of unknown function DUF159  28.02 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.334865  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0311  hypothetical protein  35.71 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  29.31 
 
 		 337 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  32.26 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  26.9 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  26.29 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  24.02 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  28.23 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1749  hypothetical protein  35.29 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  33.82 
 
 		 235 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  27.73 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  22.22 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  30.36 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  27.43 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  33.66 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0315  hypothetical protein  28.89 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  31.21 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  26.79 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  27.11 
 
 		 253 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  27.83 
 
 		 251 aa  52  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  22.99 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  27.14 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  26.94 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  34.41 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0200  hypothetical protein  26.53 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.189466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  25.4 
 
 		 290 aa  51.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  24.72 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  24.72 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  28.85 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  29.41 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  27.89 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  34 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0478  protein of unknown function DUF159  25.99 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  31.68 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  29.17 
 
 		 346 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  36.96 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  29.31 
 
 		 281 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  26.32 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 233 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  26.79 
 
 		 262 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04161  DUF159 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13150)  27.66 
 
 		 388 aa  48.9  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0736847  normal  0.55935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  23.67 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3992  hypothetical protein  31.01 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  30.61 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  32.98 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  26.44 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  31.07 
 
 		 274 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  25.4 
 
 		 253 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  29.82 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  22.42 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  27.17 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  31.08 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  29.92 
 
 		 285 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>