191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1749 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1749  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  38.51 
 
 
244 aa  97.8  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  37.25 
 
 
253 aa  94.7  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  34.9 
 
 
223 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  35.57 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  33.78 
 
 
234 aa  90.5  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  35.92 
 
 
222 aa  87.8  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  30.27 
 
 
222 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  36.62 
 
 
236 aa  86.3  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  34.01 
 
 
222 aa  85.5  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  34.48 
 
 
226 aa  85.5  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  32.65 
 
 
235 aa  85.1  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  33.79 
 
 
226 aa  84.7  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  34 
 
 
224 aa  84.7  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  38.67 
 
 
268 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  33.33 
 
 
232 aa  84  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  38.82 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  31.47 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  28.49 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  34.19 
 
 
253 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  35.17 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  31.21 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  36.99 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  35.33 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  34.69 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  33.77 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  35.42 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  34.56 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  33.99 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  30.67 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  38.67 
 
 
248 aa  74.7  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  33.12 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  35.29 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  31.82 
 
 
231 aa  74.3  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  33.12 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  33.8 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  33.55 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  32.69 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  32 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  32.19 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  31.48 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  30.82 
 
 
259 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  34.04 
 
 
252 aa  71.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  31.35 
 
 
290 aa  71.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  31.97 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04161  DUF159 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13150)  31.21 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0736847  normal  0.55935 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3022  hypothetical protein  34.09 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.310509  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  30.67 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  32.87 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  27.33 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  38.3 
 
 
248 aa  68.2  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  34 
 
 
338 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  33.11 
 
 
252 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  30.88 
 
 
256 aa  68.2  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  32.39 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  30.72 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  33.82 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0734  hypothetical protein  31.03 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  30.61 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  31.16 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  31.91 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  31.47 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2383  hypothetical protein  30.77 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.518006 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  33.56 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  30.99 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  31.69 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  32.88 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  28.66 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  31.29 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  31.25 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  30.56 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  33.79 
 
 
253 aa  64.7  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  30.77 
 
 
248 aa  64.7  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  32.67 
 
 
233 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  27.66 
 
 
254 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  26.23 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 
254 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  31.97 
 
 
242 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  34.87 
 
 
252 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2763  hypothetical protein  29.66 
 
 
229 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0250851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  30.5 
 
 
257 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  31.08 
 
 
281 aa  62.8  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  22.32 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  32.06 
 
 
257 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  31.85 
 
 
261 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  26.24 
 
 
222 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  26.24 
 
 
222 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  31.21 
 
 
266 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  31.21 
 
 
266 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  30.63 
 
 
231 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  32.43 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  25.53 
 
 
222 aa  62  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  33.58 
 
 
246 aa  62  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0758  hypothetical protein  29.58 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0786  hypothetical protein  29.58 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0800  hypothetical protein  30.28 
 
 
206 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  28.68 
 
 
222 aa  61.6  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>