More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3700 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 261 aa  531  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  90.04 
 
 		 261 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  89.27 
 
 		 261 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  80.46 
 
 		 261 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  78.16 
 
 		 261 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  78.16 
 
 		 261 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  59.52 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  57.81 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 282 aa  315  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  58.89 
 
 		 271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2323  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  58.59 
 
 		 257 aa  310  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483469  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 		 255 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  58.59 
 
 		 277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0306  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  60.08 
 
 		 267 aa  308  8e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137592  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5218  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  58.59 
 
 		 278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29460  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.57 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  56.92 
 
 		 271 aa  298  6e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  56.08 
 
 		 254 aa  291  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 		 274 aa  288  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0380477  normal  0.0820777 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  55.16 
 
 		 254 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  53.33 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.69 
 
 		 245 aa  276  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  54.15 
 
 		 248 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  54.94 
 
 		 255 aa  274  9e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  53.15 
 
 		 260 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  53.78 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  53.54 
 
 		 260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  56.59 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  54.3 
 
 		 257 aa  271  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  53.39 
 
 		 250 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  53.94 
 
 		 246 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  54.18 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  53.15 
 
 		 246 aa  268  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.94 
 
 		 244 aa  268  7e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.38 
 
 		 240 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  53.28 
 
 		 252 aa  268  8.999999999999999e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.78 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.29 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  53.33 
 
 		 245 aa  266  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  57.6 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.96 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  53.94 
 
 		 250 aa  265  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  53.39 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  53.39 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  52.99 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  52.99 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  53.39 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  53.57 
 
 		 255 aa  264  8e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  53.78 
 
 		 247 aa  265  8e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.98 
 
 		 240 aa  264  8e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0669  ABC transporter related  53.5 
 
 		 247 aa  264  8.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0798533 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  54.15 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  55.38 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  52.59 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  55.38 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  56.4 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  51.97 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  53.39 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  53.39 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  51.78 
 
 		 259 aa  262  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  51.76 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  53.78 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  51.76 
 
 		 254 aa  262  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  52.36 
 
 		 270 aa  262  4e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  54.58 
 
 		 244 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  52.59 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.57 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  54.96 
 
 		 258 aa  262  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  52.55 
 
 		 252 aa  261  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  50.98 
 
 		 254 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 		 240 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  52.99 
 
 		 241 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  55.47 
 
 		 254 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  53.63 
 
 		 261 aa  261  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.18 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.18 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.18 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.18 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  50.2 
 
 		 268 aa  260  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  51.17 
 
 		 274 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.95 
 
 		 244 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.37 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  51.37 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  51.56 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  50.79 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  51.39 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  53.78 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  52.55 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3562  ABC transporter related  55.06 
 
 		 257 aa  259  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.37 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  52.99 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  54.98 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  51.39 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  53.73 
 
 		 254 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  53.39 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  50.79 
 
 		 252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>