More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2419 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6766  hypothetical protein  81.23 
 
 		 390 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5853  hypothetical protein  79.69 
 
 		 390 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2419  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  786    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.337062 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0355  hypothetical protein  76.8 
 
 		 389 aa  640    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5346  hypothetical protein  74.81 
 
 		 390 aa  621  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3322  hypothetical protein  56.6 
 
 		 392 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0572768 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4805  MATE efflux family protein  49.62 
 
 		 868 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5727  hypothetical protein  50.4 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0500191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3552  hypothetical protein  48.58 
 
 		 383 aa  352  5.9999999999999994e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1550  cystathionine gamma-lyase  41.84 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1501  cystathionine gamma-lyase  43.09 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  38.08 
 
 		 391 aa  255  8e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  42.89 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  38.86 
 
 		 392 aa  249  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  37.63 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  37.3 
 
 		 393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  37.57 
 
 		 397 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1630  Cystathionine beta-lyase  40.21 
 
 		 386 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  37.57 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  37 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  36.59 
 
 		 413 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  35.23 
 
 		 392 aa  242  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  37.3 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  38.4 
 
 		 408 aa  239  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  37.1 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  34.38 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  35.92 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  36.96 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  36.27 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  36.19 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  37.03 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  36.06 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  37.03 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  36 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  35.66 
 
 		 397 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  35.82 
 
 		 386 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  37.2 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  38.21 
 
 		 397 aa  232  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  35.73 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  36.56 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  37.94 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  39.23 
 
 		 388 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  38.46 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  36.29 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  38.76 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.86 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  37.84 
 
 		 393 aa  227  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  37.9 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  36.66 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  38.17 
 
 		 390 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  36.98 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  36.25 
 
 		 382 aa  224  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.15 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  36.34 
 
 		 383 aa  223  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  35.92 
 
 		 392 aa  223  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  34.93 
 
 		 405 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  35.19 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  36.36 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  35.19 
 
 		 392 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  34.15 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.64 
 
 		 383 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  35.19 
 
 		 392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  32.82 
 
 		 390 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  35.2 
 
 		 401 aa  219  5e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  36.78 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  35.41 
 
 		 406 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  36.78 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  35.19 
 
 		 391 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  35.19 
 
 		 391 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  37.5 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  34.51 
 
 		 391 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  35.86 
 
 		 393 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  34.78 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  34.78 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  34.78 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3333  Cystathionine gamma-synthase  37.2 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4085  cystathionine beta-lyase  38.48 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131173  normal  0.238155 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.92 
 
 		 393 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  37.33 
 
 		 377 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  36.14 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  34.69 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  36.12 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  36.78 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  36.51 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  36.6 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  38.3 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  36.51 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  36.51 
 
 		 377 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  36.63 
 
 		 378 aa  216  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  36.51 
 
 		 377 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  36.51 
 
 		 377 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  38.48 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  36.51 
 
 		 377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0801  cystathionine gamma-synthase  37.16 
 
 		 367 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  35.86 
 
 		 391 aa  216  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  34.85 
 
 		 396 aa  216  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  36.34 
 
 		 378 aa  215  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  35.79 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  36.51 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  33.68 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>