More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2311 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2311  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 135 aa  256  9e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113317  normal  0.278177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  56.56 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2837  MerR family transcriptional regulator  54.96 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  57.38 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2682  putative regulatory protein  52.8 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  49.6 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0423  MerR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0033  MerR family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  45.74 
 
 		 135 aa  114  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0248  MerR family transcriptional regulator  52.42 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.849473  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4273  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 139 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  48.41 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3589  MerR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1595  MerR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.146181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3837  MerR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265561  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2614  MerR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2579  MerR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136218  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  44.27 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 154 aa  99.4  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  44.35 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3347  MerR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  39.02 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0056  soxR protein  33.93 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0560475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  35.71 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01780  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.95899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  34.82 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  38.74 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3141  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.74 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0926  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1287  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0738  transcriptional regulator, MerR family  36.61 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0208  MerR family regulatory protein  36.19 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7803  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3280  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1546  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.548833  normal  0.109608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2133  MerR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0098213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2070  MerR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00505229  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2087  MerR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183046  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  51.47 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1565  transcriptional regulator, MerR family protein  31.3 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  36.94 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1612  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.26 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.74 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0408  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36.61 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2125  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.25 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0226644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4984  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  39.25 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5793  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  39.36 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2950  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4594  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1099  transcriptional regulator, MerR family  32.46 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3620  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.065575  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  34.82 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4130  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.442587  normal  0.0543283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5536  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4747  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2967  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.63 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4811  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>