68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5622 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
407 aa  850    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  60.31 
 
 
382 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2778  hypothetical protein  46.81 
 
 
464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2735  hypothetical protein  43.68 
 
 
459 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338908  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4084  hypothetical protein  41.5 
 
 
472 aa  252  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.200765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  25.54 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  27.27 
 
 
385 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  25.77 
 
 
345 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  27.27 
 
 
328 aa  77  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  25.07 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  24.19 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  26.79 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  25.22 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  23.86 
 
 
710 aa  66.2  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  24.77 
 
 
651 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  24.61 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  26.01 
 
 
321 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  27.41 
 
 
298 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  22.67 
 
 
425 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  27.33 
 
 
298 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  30.88 
 
 
318 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  36.21 
 
 
868 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  27.41 
 
 
299 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  28.36 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  27.86 
 
 
297 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  27.86 
 
 
320 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5814  hypothetical protein  28.18 
 
 
208 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  25.47 
 
 
368 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  37.5 
 
 
467 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  24 
 
 
374 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  29.94 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  31.25 
 
 
307 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  24.54 
 
 
362 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  28.79 
 
 
333 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  28.91 
 
 
1010 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  27.27 
 
 
292 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  25.17 
 
 
301 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  23.2 
 
 
355 aa  47.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  28.45 
 
 
968 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  29.61 
 
 
312 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  27.46 
 
 
358 aa  46.6  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  27.86 
 
 
378 aa  46.6  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  31.97 
 
 
897 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  27.69 
 
 
308 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  33.72 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  29.41 
 
 
248 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  28.08 
 
 
356 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  27.7 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  22.75 
 
 
347 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  24.85 
 
 
351 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3664  hypothetical protein  47.73 
 
 
669 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  26.59 
 
 
329 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  24.42 
 
 
342 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  28.67 
 
 
292 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  23.18 
 
 
367 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  26.57 
 
 
359 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2978  hypothetical protein  24.73 
 
 
360 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484225 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  23.35 
 
 
320 aa  43.9  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  29.17 
 
 
349 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  24.2 
 
 
372 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  26.43 
 
 
378 aa  43.1  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  31.43 
 
 
309 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  23.35 
 
 
275 aa  43.5  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  28.33 
 
 
349 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  29.6 
 
 
254 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  25.57 
 
 
285 aa  43.1  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  26.9 
 
 
304 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  27.34 
 
 
330 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>