More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5428 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  100 
 
 
389 aa  799    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  43.47 
 
 
372 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  42.29 
 
 
400 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  42.13 
 
 
379 aa  278  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  38.95 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  36.1 
 
 
385 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  34.29 
 
 
395 aa  220  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  35.98 
 
 
382 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  35.69 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  35.11 
 
 
395 aa  203  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  34.65 
 
 
372 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  36.02 
 
 
402 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  35.39 
 
 
370 aa  194  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  35.47 
 
 
365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  34.44 
 
 
386 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  34.16 
 
 
386 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  34.16 
 
 
386 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  32.68 
 
 
357 aa  159  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  32.51 
 
 
386 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  29.78 
 
 
440 aa  158  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  31.88 
 
 
330 aa  155  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  32.21 
 
 
373 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  33.94 
 
 
337 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  33.74 
 
 
337 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  33.52 
 
 
390 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  32.32 
 
 
374 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  31.54 
 
 
368 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  29.5 
 
 
348 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  32.77 
 
 
366 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  33.53 
 
 
323 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  32.62 
 
 
338 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  33.44 
 
 
338 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.73 
 
 
347 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  33.33 
 
 
385 aa  149  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  31.9 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  33.73 
 
 
337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  32 
 
 
338 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  32.31 
 
 
338 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  32.15 
 
 
334 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  30.86 
 
 
398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  33.84 
 
 
337 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  30.97 
 
 
338 aa  145  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  31.25 
 
 
397 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  33.33 
 
 
349 aa  143  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  34.1 
 
 
372 aa  143  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  31.59 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  32.6 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  29.74 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  30.92 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  33.8 
 
 
363 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  32.41 
 
 
385 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  33.07 
 
 
380 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  31.39 
 
 
369 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  29.95 
 
 
449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  31.07 
 
 
381 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  30.95 
 
 
368 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  33.33 
 
 
389 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  28.81 
 
 
367 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  30.12 
 
 
347 aa  136  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  29.7 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  30.06 
 
 
342 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  28.93 
 
 
425 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  28.7 
 
 
316 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  31.69 
 
 
344 aa  132  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  31.04 
 
 
346 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  30.24 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  31.47 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  29.77 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  31.28 
 
 
398 aa  126  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  31.3 
 
 
370 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  27.25 
 
 
385 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  28.03 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  29.91 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  30.65 
 
 
323 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  28.69 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  29.18 
 
 
354 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  26.92 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  29.18 
 
 
340 aa  119  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  28.74 
 
 
329 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  27.75 
 
 
306 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  27.97 
 
 
318 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  31.09 
 
 
351 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0061  hypothetical protein  29.65 
 
 
337 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  28.69 
 
 
389 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  29.45 
 
 
307 aa  116  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  27.83 
 
 
421 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.33 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  31.12 
 
 
249 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  28.37 
 
 
375 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  30.18 
 
 
362 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  29.97 
 
 
433 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  29.69 
 
 
341 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  31.02 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  31.33 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  30.38 
 
 
526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.02 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  29.91 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  31.33 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  29.18 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  35.29 
 
 
265 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>