More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4406 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  59.55 
 
 		 630 aa  773    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  50.63 
 
 		 621 aa  663    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  100 
 
 		 630 aa  1298    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  49.68 
 
 		 620 aa  654    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 622 aa  662    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  50.31 
 
 		 634 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  48.49 
 
 		 620 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 622 aa  601  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 		 623 aa  581  1e-164  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  44.25 
 
 		 642 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  45.47 
 
 		 631 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  45.07 
 
 		 631 aa  549  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  45.07 
 
 		 631 aa  549  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 		 631 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  45.07 
 
 		 631 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  44.91 
 
 		 631 aa  545  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  44.1 
 
 		 642 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  44.91 
 
 		 631 aa  545  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  44.63 
 
 		 642 aa  548  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 		 631 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  45 
 
 		 630 aa  542  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  44.6 
 
 		 631 aa  542  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 		 631 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  43.19 
 
 		 631 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  46.45 
 
 		 643 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  43.08 
 
 		 653 aa  520  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  44.58 
 
 		 629 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  42.99 
 
 		 646 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  43.1 
 
 		 642 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 642 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  43.59 
 
 		 630 aa  514  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  44.13 
 
 		 626 aa  512  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  43.42 
 
 		 632 aa  509  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  42.99 
 
 		 640 aa  511  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  43.21 
 
 		 632 aa  504  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 629 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  41.02 
 
 		 639 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  39.06 
 
 		 636 aa  489  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  42.59 
 
 		 630 aa  482  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  42.92 
 
 		 631 aa  482  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  41.95 
 
 		 641 aa  479  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  38.7 
 
 		 613 aa  478  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  39.12 
 
 		 622 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  39.12 
 
 		 625 aa  465  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  46.11 
 
 		 723 aa  462  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  40.09 
 
 		 625 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  40.09 
 
 		 625 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  40.32 
 
 		 626 aa  458  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  39.14 
 
 		 652 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  39.31 
 
 		 641 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  40.03 
 
 		 623 aa  442  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 627 aa  437  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  38.85 
 
 		 631 aa  433  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  37.93 
 
 		 633 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  38.69 
 
 		 641 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  38.92 
 
 		 644 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  41.09 
 
 		 653 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  36.29 
 
 		 600 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  36.29 
 
 		 600 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41351  predicted protein  36.05 
 
 		 679 aa  393  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  37.52 
 
 		 634 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  36.34 
 
 		 636 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.72 
 
 		 558 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  36.2 
 
 		 626 aa  379  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  35.49 
 
 		 596 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.36 
 
 		 564 aa  375  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 592 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3854  ABC transporter related  36.76 
 
 		 611 aa  378  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.53962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  35.81 
 
 		 632 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37.9 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  37.9 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5906  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.9 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.05 
 
 		 555 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 555 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4941  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.9 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3665  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.9 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04232  hypothetical protein  37.9 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  35.66 
 
 		 633 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004402  ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485845  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  37.86 
 
 		 654 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.9 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.05 
 
 		 555 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.9 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.62 
 
 		 556 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00997  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 		 555 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.57 
 
 		 563 aa  373  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.48 
 
 		 558 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 		 551 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.08 
 
 		 559 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4905  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.9 
 
 		 555 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  35.24 
 
 		 600 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4832  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.9 
 
 		 555 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 		 561 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.9 
 
 		 559 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3678  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 		 555 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  35.12 
 
 		 612 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.9 
 
 		 555 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.05 
 
 		 555 aa  371  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0671  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.19 
 
 		 555 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.6 
 
 		 555 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>