213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3232 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  100 
 
 
230 aa  478  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  46.82 
 
 
232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  44.14 
 
 
230 aa  211  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  39.73 
 
 
227 aa  191  7e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  41.07 
 
 
230 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  41.07 
 
 
230 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  38.84 
 
 
230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  39.01 
 
 
230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  38.84 
 
 
230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  38.84 
 
 
230 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  38.84 
 
 
230 aa  181  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  38.84 
 
 
230 aa  181  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  38.84 
 
 
230 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  38.84 
 
 
230 aa  181  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  38.84 
 
 
230 aa  181  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  38.84 
 
 
230 aa  181  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  40.62 
 
 
230 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  40.62 
 
 
230 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  40.62 
 
 
230 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  37.84 
 
 
230 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  37.84 
 
 
230 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  37.61 
 
 
225 aa  162  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  38.36 
 
 
272 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  38.36 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2486  hypothetical protein  36.65 
 
 
163 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  31.58 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  29.39 
 
 
228 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  27.9 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  35.26 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  27.75 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  28.07 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3116  protein of unknown function DUF421  27.11 
 
 
229 aa  92  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  29.89 
 
 
237 aa  91.7  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  29.3 
 
 
224 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  27.59 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  26.41 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  30.82 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  29.63 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  29.08 
 
 
228 aa  82  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  24 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  30.71 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  30.06 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  30.06 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  30.06 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  29.48 
 
 
289 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  29.48 
 
 
289 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  31.47 
 
 
286 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  29.48 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  29.3 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  29.35 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  27.32 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  30.06 
 
 
289 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  29.41 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  25 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  22.89 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  29.17 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  28.83 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  30.36 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  28.9 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  31.47 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  28.76 
 
 
289 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  29.33 
 
 
289 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  26.71 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  23.65 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  29.08 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  26.62 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  30.07 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  28.67 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  28.06 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  25.29 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  29.35 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  29.53 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  27.78 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  29.76 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  28.8 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  28.34 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  28.8 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  28.8 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  28.8 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  26.14 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  29.35 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0520  protein of unknown function DUF421  24.79 
 
 
233 aa  68.2  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1698  hypothetical protein  23.96 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2639  YdfS  27.22 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  31.45 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  25.52 
 
 
149 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  31.69 
 
 
147 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  26.21 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  27.54 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1059  protein of unknown function DUF421  27.45 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  24.7 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  23.49 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  24.42 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  30.88 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  24.22 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  28.3 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  22.89 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  22.45 
 
 
165 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  27.61 
 
 
165 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  25.17 
 
 
164 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>