58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21580 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  100 
 
 		 640 aa  1189    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  48.47 
 
 		 648 aa  449  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2456  protein of unknown function DUF214  45.3 
 
 		 627 aa  260  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0496014  hitchhiker  0.00000468222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  36.02 
 
 		 822 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  35.07 
 
 		 852 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  33.45 
 
 		 863 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  31.92 
 
 		 838 aa  136  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  34.49 
 
 		 874 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  32.97 
 
 		 822 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  30.13 
 
 		 807 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  29.14 
 
 		 854 aa  118  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  32.43 
 
 		 828 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.41 
 
 		 855 aa  97.4  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  31.57 
 
 		 841 aa  93.6  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  30.95 
 
 		 823 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  38.1 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.82 
 
 		 843 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  31.18 
 
 		 839 aa  67  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 		 855 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  28 
 
 		 638 aa  63.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4404  protein of unknown function DUF214  31.94 
 
 		 822 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 		 856 aa  61.6  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  25.59 
 
 		 842 aa  61.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1915  protein of unknown function DUF214  30.53 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 		 878 aa  60.1  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  27.68 
 
 		 821 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  27.24 
 
 		 836 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3549  protein of unknown function DUF214  36.88 
 
 		 881 aa  57  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  26.67 
 
 		 841 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  36.36 
 
 		 866 aa  56.2  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 		 834 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  29.5 
 
 		 643 aa  55.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  30.38 
 
 		 852 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  22.44 
 
 		 897 aa  53.1  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 		 859 aa  53.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.27 
 
 		 857 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  26.47 
 
 		 845 aa  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  41.3 
 
 		 867 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  31.85 
 
 		 855 aa  51.6  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.8 
 
 		 858 aa  50.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.94 
 
 		 859 aa  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  25.34 
 
 		 833 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.63 
 
 		 848 aa  49.7  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 861 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1094  protein of unknown function DUF214  33.56 
 
 		 969 aa  47.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 		 852 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  32.82 
 
 		 871 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  44.44 
 
 		 861 aa  45.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  32.89 
 
 		 684 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  32.89 
 
 		 829 aa  44.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2806  protein of unknown function DUF214  39.39 
 
 		 1081 aa  44.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  32.89 
 
 		 829 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 		 873 aa  44.7  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  26.71 
 
 		 896 aa  44.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  25.96 
 
 		 376 aa  44.3  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  35.14 
 
 		 873 aa  43.9  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  27.52 
 
 		 853 aa  43.9  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0320  hypothetical protein  34.13 
 
 		 401 aa  43.9  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.895075  normal  0.234249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>