193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19220 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  100 
 
 		 463 aa  905    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  33.12 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6692  membrane protein-like protein  30.8 
 
 		 324 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  28.33 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  27.35 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  28.7 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  30.99 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  27.63 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  26.3 
 
 		 351 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 330 aa  99.8  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  32.01 
 
 		 388 aa  97.4  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  28.96 
 
 		 433 aa  97.1  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  31.02 
 
 		 328 aa  96.7  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  28.31 
 
 		 360 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  27.06 
 
 		 319 aa  96.7  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  26.49 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  23.95 
 
 		 392 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  26.49 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  27.46 
 
 		 328 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  28.7 
 
 		 317 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 367 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 375 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  24.34 
 
 		 283 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  28.21 
 
 		 331 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.68 
 
 		 316 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  27.95 
 
 		 356 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  23.55 
 
 		 283 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  28.35 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  27.55 
 
 		 322 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  27.3 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.92 
 
 		 320 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  30.99 
 
 		 445 aa  90.5  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  27.27 
 
 		 341 aa  90.1  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1789  ribonuclease BN  30.07 
 
 		 300 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00331025  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  28.05 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  25.23 
 
 		 333 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  25.26 
 
 		 289 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  29.91 
 
 		 350 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  29.91 
 
 		 350 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  26.07 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  29.91 
 
 		 350 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  29.28 
 
 		 301 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  24.82 
 
 		 288 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  24.82 
 
 		 288 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  27.13 
 
 		 384 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  24.09 
 
 		 286 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  30.95 
 
 		 289 aa  87.4  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  25.63 
 
 		 349 aa  87.8  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  27.02 
 
 		 289 aa  87.4  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  29.04 
 
 		 327 aa  86.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  25.47 
 
 		 316 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  25.26 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  25.26 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  24.28 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  27.33 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  26.14 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  28.14 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  25.88 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  26.35 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  28.02 
 
 		 317 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  27.64 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  24.76 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  25.58 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  27 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  26.5 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  28.48 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  30.77 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  25.86 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  24.14 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  29.27 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  28.78 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  24.57 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  27.55 
 
 		 342 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  28.57 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  24.17 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  26.97 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  27.89 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  24.73 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  25.79 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  25.58 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  27.14 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  25.79 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  27.84 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  28.67 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  26.06 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  29.97 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  25.66 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  24.05 
 
 		 347 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  29.08 
 
 		 317 aa  73.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  25.94 
 
 		 365 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  24.05 
 
 		 347 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  26.73 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>